58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0793 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  100 
 
 		 205 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  55.37 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  41.18 
 
 		 179 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  43.26 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  46.85 
 
 		 347 aa  108  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  52.21 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  56.31 
 
 		 136 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  52 
 
 		 212 aa  100  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  50.5 
 
 		 209 aa  96.7  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  46.49 
 
 		 224 aa  95.5  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  42.5 
 
 		 292 aa  95.9  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  50.96 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  42.31 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  50.96 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  49.51 
 
 		 210 aa  90.5  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  39.77 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  37.23 
 
 		 173 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  27.83 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  31.48 
 
 		 145 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  40.4 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  36.36 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  36.19 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  30.39 
 
 		 807 aa  55.1  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  39.39 
 
 		 119 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  39.39 
 
 		 119 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  35.29 
 
 		 147 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  40.43 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  35.42 
 
 		 127 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  35.71 
 
 		 116 aa  50.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  32.04 
 
 		 139 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  35.56 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  35.35 
 
 		 137 aa  48.5  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  33.33 
 
 		 104 aa  48.1  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  32.32 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  33.67 
 
 		 116 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  34.69 
 
 		 116 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  33 
 
 		 140 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  35.05 
 
 		 126 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  31.63 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3437  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  31.31 
 
 		 148 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  32.32 
 
 		 144 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  33.66 
 
 		 139 aa  45.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  32.99 
 
 		 119 aa  45.1  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  30.68 
 
 		 147 aa  44.7  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  31.31 
 
 		 144 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  31 
 
 		 97 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  33.67 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  40.62 
 
 		 916 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  32.29 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  33.01 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  32.61 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  35.29 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  38.89 
 
 		 112 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  30.69 
 
 		 110 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  35.48 
 
 		 116 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  35.48 
 
 		 128 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  37.08 
 
 		 623 aa  42  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>