66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1087 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  91.89 
 
 		 146 aa  263  5.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  82.43 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  62.59 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  47.65 
 
 		 151 aa  140  6e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  47.15 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  47.15 
 
 		 168 aa  130  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  47.62 
 
 		 151 aa  130  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  55.17 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  48.28 
 
 		 173 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  54.24 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  51.35 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  44.63 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  48.39 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  46.22 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  45.24 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  45.6 
 
 		 152 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  46.61 
 
 		 187 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  42.52 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  49.58 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  38.93 
 
 		 161 aa  100  7e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  42.37 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  42.37 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  41.18 
 
 		 153 aa  97.4  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  44.8 
 
 		 157 aa  97.4  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  44.44 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  42.98 
 
 		 144 aa  96.7  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  38.14 
 
 		 163 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  46.67 
 
 		 143 aa  93.6  7e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  46.67 
 
 		 144 aa  93.6  7e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  42.06 
 
 		 149 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  35.04 
 
 		 145 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  32.63 
 
 		 160 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  31.4 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  34.69 
 
 		 347 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  29.73 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  33.68 
 
 		 210 aa  50.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  31.91 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  33.04 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  32.26 
 
 		 292 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  33.72 
 
 		 255 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  33.68 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  28.09 
 
 		 172 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  31.25 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  29.82 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  29.82 
 
 		 119 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  29.91 
 
 		 235 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  32.29 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  30.38 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.7 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  34.09 
 
 		 209 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  30.51 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  30.17 
 
 		 116 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  27.64 
 
 		 212 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  27.85 
 
 		 119 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  31.63 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  31.52 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  29.47 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  29.11 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  27.85 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  26.96 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  26.09 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  28.83 
 
 		 138 aa  40  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>