44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1359 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  100 
 
 		 141 aa  289  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  56.67 
 
 		 143 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  51.06 
 
 		 144 aa  144  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  51.41 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  49.63 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  54.72 
 
 		 173 aa  127  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  50 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  56.38 
 
 		 144 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  57.89 
 
 		 146 aa  121  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  45.97 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  50.55 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  46.1 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  43.9 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  44.72 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  44.72 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  49.48 
 
 		 187 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  42.98 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  42.19 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  47.75 
 
 		 144 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  46.39 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  44.44 
 
 		 148 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  44.83 
 
 		 147 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  46.3 
 
 		 161 aa  95.5  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  42.86 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  37.78 
 
 		 152 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  39.17 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  44.57 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  44.57 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  48.84 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  40.74 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  36.44 
 
 		 163 aa  87.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  38.05 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.87 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  29.2 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  29.17 
 
 		 255 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  30.63 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  30.91 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  28.21 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34.38 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  30.1 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34.38 
 
 		 119 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.18 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  30.77 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>