52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4222 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  100 
 
 		 147 aa  299  8.000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  63.25 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  63.56 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  61.34 
 
 		 168 aa  164  5e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  61.34 
 
 		 146 aa  163  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  59.2 
 
 		 150 aa  154  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  52.52 
 
 		 151 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  56.64 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  46.53 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  55.83 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  55.37 
 
 		 187 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  47.29 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  52.85 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  47.79 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  46.4 
 
 		 144 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  46.46 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  45.67 
 
 		 148 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  55 
 
 		 157 aa  123  9e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  47.22 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  51.59 
 
 		 149 aa  120  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  45.74 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  45 
 
 		 163 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  45.38 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  46.96 
 
 		 143 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  49.46 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  42.98 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  42.98 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  43.22 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  37.32 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  37.32 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  42.55 
 
 		 161 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  41.13 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  32.5 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  40.2 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  40.2 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  35.23 
 
 		 255 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  34.45 
 
 		 119 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  28.93 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  28.67 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  32.14 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  29.63 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  34.17 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  34.17 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  32.41 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  27.37 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  31.96 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  26.67 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  35.23 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  34.58 
 
 		 116 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  27.87 
 
 		 235 aa  40.8  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  31.09 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  32.22 
 
 		 160 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>