52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4276 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  100 
 
 		 146 aa  293  5e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  70 
 
 		 187 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  64.29 
 
 		 146 aa  175  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  64.17 
 
 		 150 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  58.16 
 
 		 173 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  56.64 
 
 		 151 aa  160  8.000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  52.11 
 
 		 151 aa  157  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  59.66 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  48.18 
 
 		 147 aa  140  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  52.9 
 
 		 144 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  55.83 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  53.39 
 
 		 146 aa  135  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  52.94 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  52.94 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  48.85 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  50 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  48.48 
 
 		 152 aa  130  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  55.46 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  47.97 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  47.97 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  53.6 
 
 		 146 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  52.8 
 
 		 148 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  43.54 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  50.41 
 
 		 161 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  45.19 
 
 		 150 aa  122  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  50.52 
 
 		 141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  56.52 
 
 		 149 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  51.43 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  53.61 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  50.55 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  49.45 
 
 		 143 aa  110  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  41.46 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  37.96 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  28.8 
 
 		 138 aa  52.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 173 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  30.39 
 
 		 221 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  30 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  27.91 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  29.82 
 
 		 119 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  31.11 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  43.5  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  24.6 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  31.11 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  28.42 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  30.09 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  28.42 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  29.13 
 
 		 127 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.77 
 
 		 137 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  27.03 
 
 		 125 aa  42  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  29.27 
 
 		 116 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  28.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  35.04 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>