72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1008 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  100 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  63.56 
 
 		 146 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  57.24 
 
 		 151 aa  164  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  53.47 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  57.38 
 
 		 187 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  59.83 
 
 		 147 aa  148  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  56.52 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  55.86 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  59.17 
 
 		 146 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  51.69 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  50 
 
 		 173 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  50.37 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  48.57 
 
 		 150 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  46.26 
 
 		 144 aa  126  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  49.15 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  49.15 
 
 		 168 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  59.78 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  51.64 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  51.35 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  51.35 
 
 		 146 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  49.17 
 
 		 144 aa  123  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  47.9 
 
 		 163 aa  120  4e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  57.41 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  45.97 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  47.11 
 
 		 152 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  56.67 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  45 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  45 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  46.28 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  47.11 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  46.72 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  40.83 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  40.26 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  34.17 
 
 		 173 aa  61.6  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  33.33 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34.21 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34.21 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  34.95 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  39.81 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  35.77 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  34.51 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  35.45 
 
 		 116 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  31.5 
 
 		 221 aa  51.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  32.43 
 
 		 347 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  34.43 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  33.87 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  35.45 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  33.61 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  32.73 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  35.45 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  36.36 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  26.72 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  39.29 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  38.89 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  40 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  41.67 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  40.7 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  30.19 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  29.63 
 
 		 144 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  31.85 
 
 		 137 aa  44.3  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  34.15 
 
 		 292 aa  43.9  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  34.38 
 
 		 210 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  35.23 
 
 		 186 aa  43.5  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  33.33 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  30.89 
 
 		 117 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  31 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  39.53 
 
 		 209 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  32.32 
 
 		 224 aa  41.6  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  32.95 
 
 		 255 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 		 235 aa  41.6  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  34.21 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  36.59 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>