48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0182 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  60.48 
 
 		 150 aa  158  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  48.68 
 
 		 151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  51.66 
 
 		 153 aa  149  8.999999999999999e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  51.26 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  51.7 
 
 		 173 aa  144  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  50.76 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  50.82 
 
 		 147 aa  137  4.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  51.64 
 
 		 187 aa  137  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  51.28 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  52.42 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  49.17 
 
 		 146 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  47.15 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  47.15 
 
 		 168 aa  132  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  48.41 
 
 		 146 aa  130  5e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  47.62 
 
 		 148 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  46.04 
 
 		 150 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  59.57 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  48.03 
 
 		 144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  50 
 
 		 141 aa  126  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  45.53 
 
 		 144 aa  124  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  47.24 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  48.09 
 
 		 144 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  40.14 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  40.4 
 
 		 152 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  45.9 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  45.9 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  44.63 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  39.74 
 
 		 152 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  52.13 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  42.28 
 
 		 161 aa  100  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  35.82 
 
 		 145 aa  87.8  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  37.66 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.45 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  33.94 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  28.06 
 
 		 255 aa  51.2  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  37.76 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  33.01 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  30.84 
 
 		 221 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  30.69 
 
 		 160 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  27.82 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  28.57 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  33.72 
 
 		 116 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  28.87 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  30.89 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  31.4 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  30.77 
 
 		 347 aa  40.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>