65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5841 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  100 
 
 		 152 aa  314  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  94.08 
 
 		 152 aa  297  3e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  49.64 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  50.83 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  48.33 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  46.34 
 
 		 146 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  47.46 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  46.34 
 
 		 148 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  39.86 
 
 		 147 aa  116  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  44.35 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  46.49 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  42.86 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  40.4 
 
 		 151 aa  114  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  44.53 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  42.86 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  47.11 
 
 		 150 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  43.97 
 
 		 187 aa  106  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  40.34 
 
 		 146 aa  105  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  40.68 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  41.38 
 
 		 163 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  40.68 
 
 		 152 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  37.59 
 
 		 150 aa  100  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  42.98 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  38.33 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  46.24 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  42.02 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  37.4 
 
 		 157 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  37.88 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  43.56 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  40.71 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  35.94 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  35.38 
 
 		 153 aa  84.3  5e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  34.94 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  32.86 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  34.38 
 
 		 235 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  27.74 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  33.94 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  34.95 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  37.5 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  37.5 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  35.51 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  35.56 
 
 		 255 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  35.11 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.99 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  36.44 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  34.75 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  36.44 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  35.59 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  34.74 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  36.26 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  34.74 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  36 
 
 		 127 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  37.21 
 
 		 224 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  37.25 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  33.68 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  31.25 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  27.01 
 
 		 138 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  30.3 
 
 		 347 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.97 
 
 		 119 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  34.65 
 
 		 545 aa  43.9  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  28.42 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  27.97 
 
 		 212 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  31.11 
 
 		 292 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  29.9 
 
 		 209 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>