33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1597 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  100 
 
 
163 aa  330  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  86.93 
 
 
152 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  86.93 
 
 
152 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  47.37 
 
 
173 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  50 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  46.26 
 
 
151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  49.59 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  46.67 
 
 
187 aa  126  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  47.97 
 
 
150 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  47.55 
 
 
146 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  44.54 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  44.54 
 
 
168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  41.5 
 
 
151 aa  117  6e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  45 
 
 
147 aa  117  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  45.32 
 
 
153 aa  114  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  42.28 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  41.54 
 
 
152 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  40.94 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  42.06 
 
 
144 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  44.54 
 
 
157 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  38.41 
 
 
147 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  42.45 
 
 
144 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  38.98 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  38.58 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  38.58 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  42.86 
 
 
141 aa  91.3  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  36.8 
 
 
150 aa  90.9  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  44.44 
 
 
149 aa  90.1  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  38.1 
 
 
144 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  37.4 
 
 
143 aa  84.3  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  31.03 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  31.15 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  32.29 
 
 
146 aa  56.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>