96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1015 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  100 
 
 
126 aa  264  2.9999999999999995e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  90.76 
 
 
119 aa  229  1e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  74.58 
 
 
119 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  75.86 
 
 
116 aa  190  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  74.58 
 
 
128 aa  189  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  75 
 
 
116 aa  186  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  73.28 
 
 
116 aa  185  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  70.69 
 
 
116 aa  181  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  69.83 
 
 
116 aa  180  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  70.69 
 
 
116 aa  178  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  56.56 
 
 
125 aa  149  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  62.63 
 
 
119 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  62.63 
 
 
119 aa  141  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  48.82 
 
 
127 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  52.34 
 
 
139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  44.44 
 
 
139 aa  102  1e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  48.54 
 
 
104 aa  100  6e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  41.67 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  42.86 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  40.57 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  36.26 
 
 
179 aa  60.8  0.000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  32.41 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.39 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  29.29 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  38.55 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  35.48 
 
 
224 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  41.11 
 
 
347 aa  57.8  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  35.48 
 
 
210 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  39.42 
 
 
151 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  32.38 
 
 
173 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.91 
 
 
417 aa  53.9  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  33.33 
 
 
131 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  35.96 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  38.1 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  34.31 
 
 
807 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  34.38 
 
 
292 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  39.36 
 
 
186 aa  52  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  35.85 
 
 
111 aa  51.2  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  32.38 
 
 
221 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  34.44 
 
 
212 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  40.62 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  35.79 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  36.56 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  34.44 
 
 
209 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  34.74 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  32.05 
 
 
264 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  33.33 
 
 
119 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  33.66 
 
 
235 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  30.83 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32.47 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  34.02 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  29.31 
 
 
144 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  32.67 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  31.87 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  37.62 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  37.18 
 
 
172 aa  47.8  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  32.5 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  31.25 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  30.77 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  42.86 
 
 
318 aa  47.4  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  35.96 
 
 
150 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  40.62 
 
 
112 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  30 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  32.2 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  39.58 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  33.77 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  38.46 
 
 
136 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  31.76 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  28.95 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  27.27 
 
 
153 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  31.82 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  29.35 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  30.19 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  33.04 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  29.82 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  58.06 
 
 
146 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.36 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  29.82 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 
120 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  33.33 
 
 
173 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  27.16 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  35.71 
 
 
358 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  31.58 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  33.8 
 
 
123 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  31.58 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  34.33 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.38 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  24.41 
 
 
336 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
179 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  27.19 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  30.1 
 
 
545 aa  40.8  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  27.78 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>