56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3100 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  77.84 
 
 		 210 aa  243  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  54.02 
 
 		 212 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  55.17 
 
 		 179 aa  172  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  46.26 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  52.94 
 
 		 347 aa  128  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  42.6 
 
 		 214 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  42.14 
 
 		 160 aa  108  9.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  49.58 
 
 		 231 aa  99.4  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  46.49 
 
 		 205 aa  98.6  6e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  43.22 
 
 		 292 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  52.1 
 
 		 186 aa  96.3  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  34.22 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  39.49 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  43.69 
 
 		 136 aa  73.9  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  36 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  36.17 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  36.17 
 
 		 119 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  34.26 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  35.48 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  35.87 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  36.96 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  35.11 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  35.48 
 
 		 126 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  35.87 
 
 		 116 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  30.89 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  35.11 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  34.78 
 
 		 116 aa  55.1  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  41 
 
 		 807 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  28.33 
 
 		 173 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  31.11 
 
 		 119 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  32.8 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  27.62 
 
 		 255 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  41.1 
 
 		 179 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  35.87 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  39.77 
 
 		 172 aa  47.4  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  36.78 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  30.65 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  37.35 
 
 		 110 aa  46.6  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  34.18 
 
 		 112 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  29.84 
 
 		 146 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  39.02 
 
 		 147 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  25.45 
 
 		 145 aa  45.4  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  31.03 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.11 
 
 		 127 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  34.62 
 
 		 146 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  35.8 
 
 		 116 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  37.65 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  30 
 
 		 104 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.46 
 
 		 157 aa  43.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  28.16 
 
 		 151 aa  42.4  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 		 123 aa  42.4  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  33.33 
 
 		 144 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  32.32 
 
 		 150 aa  41.6  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>