67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0331 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  967    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  77.14 
 
 		 434 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  56.98 
 
 		 447 aa  488  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  55.83 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  53.47 
 
 		 461 aa  429  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  53.61 
 
 		 450 aa  427  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  58.03 
 
 		 425 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  53.77 
 
 		 436 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  50.69 
 
 		 446 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  48.2 
 
 		 408 aa  375  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  45.08 
 
 		 600 aa  303  5.000000000000001e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  42.66 
 
 		 597 aa  301  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  46.11 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  43.93 
 
 		 601 aa  298  1e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  42.62 
 
 		 601 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  42.98 
 
 		 586 aa  286  5e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  26.93 
 
 		 544 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.35 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  26.61 
 
 		 550 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  29.36 
 
 		 392 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  26.27 
 
 		 369 aa  86.7  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  24.37 
 
 		 1025 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  32.77 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.01 
 
 		 873 aa  81.6  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  29.11 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.79 
 
 		 1276 aa  79  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.13 
 
 		 596 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.91 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.71 
 
 		 415 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  24.1 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  24.77 
 
 		 340 aa  72.4  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 437 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  25.63 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  22.99 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  26.62 
 
 		 801 aa  64.7  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  22.61 
 
 		 562 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  25.78 
 
 		 558 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  21.26 
 
 		 442 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  20.98 
 
 		 442 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  25.77 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  23.54 
 
 		 891 aa  60.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  25.77 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  25.77 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  25.77 
 
 		 452 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  24.86 
 
 		 605 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  24.05 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  25.46 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  22.9 
 
 		 584 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  21.61 
 
 		 489 aa  57  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  24.84 
 
 		 662 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  24.15 
 
 		 534 aa  57  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.03 
 
 		 444 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  23.41 
 
 		 448 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  23.48 
 
 		 398 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  40.7 
 
 		 916 aa  51.6  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  49.23 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  23.48 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  21.63 
 
 		 437 aa  47.4  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.75 
 
 		 1141 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  47.89 
 
 		 1281 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  24.85 
 
 		 604 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  33.33 
 
 		 715 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  22.89 
 
 		 602 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  47.5 
 
 		 778 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2011  periplasmic binding protein  39.13 
 
 		 662 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00756421  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  48.53 
 
 		 244 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>