77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0740 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  76.15 
 
 
476 aa  696    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  880    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  60.32 
 
 
447 aa  505  9.999999999999999e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  59.59 
 
 
453 aa  491  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  53.56 
 
 
461 aa  432  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  53.56 
 
 
450 aa  426  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  58.79 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  58.4 
 
 
436 aa  414  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  49.55 
 
 
446 aa  390  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  50.56 
 
 
408 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  48.45 
 
 
596 aa  313  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  44.26 
 
 
597 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  45.66 
 
 
600 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  44.2 
 
 
601 aa  300  2e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  43.92 
 
 
601 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  44.38 
 
 
586 aa  292  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  26.27 
 
 
544 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  27.1 
 
 
550 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  27.45 
 
 
550 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.38 
 
 
1276 aa  91.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  28.66 
 
 
392 aa  90.5  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  28.18 
 
 
372 aa  90.5  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  27.11 
 
 
369 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  27.38 
 
 
1025 aa  86.3  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  33.33 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  24.32 
 
 
340 aa  76.6  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.02 
 
 
873 aa  76.3  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  26.76 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  24.1 
 
 
437 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  25.07 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  23.51 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  22.83 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  22.54 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  27.55 
 
 
803 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  23.48 
 
 
564 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25 
 
 
605 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.7 
 
 
415 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  27.57 
 
 
801 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  23.91 
 
 
437 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  21.98 
 
 
562 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  23.26 
 
 
891 aa  61.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  23.71 
 
 
534 aa  60.5  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0810  laminin G  60.34 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.478954  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.49 
 
 
444 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  26.96 
 
 
662 aa  57  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  24.1 
 
 
448 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  25.7 
 
 
558 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  23.17 
 
 
398 aa  55.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  52.46 
 
 
830 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  21.22 
 
 
489 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  25.7 
 
 
510 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  25.7 
 
 
510 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  25.7 
 
 
510 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  25.7 
 
 
510 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  25.7 
 
 
452 aa  51.6  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1203  beta-Ig-H3/fasciclin  40.79 
 
 
778 aa  50.4  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0966614  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  35.48 
 
 
1281 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.15 
 
 
530 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1781  SH3 type 3 domain protein  43.24 
 
 
489 aa  47.8  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  52.73 
 
 
1394 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4505  PT repeat-containing protein  46.25 
 
 
453 aa  47.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  48.81 
 
 
846 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1598  hypothetical protein  56 
 
 
675 aa  47  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000695683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  24.24 
 
 
614 aa  46.6  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.97 
 
 
1141 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  22.78 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  22.78 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  57.38 
 
 
455 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  22.78 
 
 
450 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  41.67 
 
 
667 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  41.98 
 
 
243 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  52.78 
 
 
1409 aa  45.8  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1931  hypothetical protein  30.4 
 
 
429 aa  45.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00823138  normal  0.409118 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2643  hypothetical protein  41.67 
 
 
323 aa  44.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.881158  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4336  alpha amylase catalytic region  45 
 
 
914 aa  44.3  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.06 
 
 
584 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>