67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0064 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  100 
 
 
544 aa  1110    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  43.57 
 
 
550 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  43.81 
 
 
550 aa  395  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  41.4 
 
 
1025 aa  367  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  30.25 
 
 
408 aa  163  8.000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  27.56 
 
 
392 aa  127  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  27.2 
 
 
436 aa  120  6e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.26 
 
 
586 aa  116  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  27.73 
 
 
447 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  26.01 
 
 
446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  26.29 
 
 
476 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  27.73 
 
 
453 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  28.31 
 
 
369 aa  113  9e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  25.61 
 
 
434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  27.51 
 
 
380 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  26.4 
 
 
425 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  27.27 
 
 
600 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  26.77 
 
 
372 aa  104  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  25.07 
 
 
461 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  27.47 
 
 
601 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  26.76 
 
 
596 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  24.87 
 
 
450 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  26.63 
 
 
597 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.28 
 
 
340 aa  97.4  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  30.19 
 
 
1276 aa  95.9  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  26.4 
 
 
601 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  26.67 
 
 
415 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  26.19 
 
 
596 aa  73.9  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  25.83 
 
 
584 aa  73.9  0.000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  23.89 
 
 
891 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  27.31 
 
 
801 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  27.6 
 
 
803 aa  68.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  24.01 
 
 
662 aa  66.6  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  22.62 
 
 
398 aa  60.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.95 
 
 
602 aa  60.1  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  30.43 
 
 
605 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  23.8 
 
 
481 aa  57  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  25.83 
 
 
604 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  23.53 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  23.53 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  23.53 
 
 
450 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  26.94 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  26.67 
 
 
534 aa  54.7  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  21.52 
 
 
326 aa  53.9  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  21.39 
 
 
510 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.12 
 
 
554 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.04 
 
 
442 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.04 
 
 
442 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.04 
 
 
442 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.04 
 
 
442 aa  51.6  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  21.2 
 
 
510 aa  51.2  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.04 
 
 
442 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.04 
 
 
442 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.04 
 
 
442 aa  51.2  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  21.2 
 
 
510 aa  51.2  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  21.2 
 
 
510 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  21.2 
 
 
510 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  21.39 
 
 
558 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  22.75 
 
 
1086 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
685 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  26.04 
 
 
450 aa  49.3  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.68 
 
 
684 aa  49.3  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  21.67 
 
 
452 aa  48.5  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  28.1 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  23.89 
 
 
654 aa  47.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  21.92 
 
 
444 aa  44.3  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  23.89 
 
 
614 aa  43.9  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>