105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0080 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  100 
 
 
715 aa  1452    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  25.14 
 
 
713 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24.31 
 
 
699 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  26.38 
 
 
663 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  23.4 
 
 
672 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  23.26 
 
 
672 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  23.8 
 
 
672 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  24.82 
 
 
697 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  23.8 
 
 
685 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  23.6 
 
 
686 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  25.6 
 
 
639 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  25.89 
 
 
667 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  26.71 
 
 
657 aa  129  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  23.01 
 
 
662 aa  126  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  23.19 
 
 
697 aa  124  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  24.02 
 
 
670 aa  121  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  21.85 
 
 
677 aa  120  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  23.12 
 
 
680 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  24.6 
 
 
669 aa  118  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  24.7 
 
 
682 aa  117  6e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  21.63 
 
 
683 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  23.55 
 
 
649 aa  115  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  22.08 
 
 
667 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  23.11 
 
 
686 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  23.11 
 
 
686 aa  115  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  22.4 
 
 
683 aa  113  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  22.79 
 
 
685 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  21.32 
 
 
689 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  23.17 
 
 
649 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  21.24 
 
 
689 aa  110  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  21.07 
 
 
691 aa  110  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  22.02 
 
 
685 aa  110  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  24.34 
 
 
635 aa  109  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  24.14 
 
 
673 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  25 
 
 
660 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  20.52 
 
 
679 aa  107  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  22 
 
 
672 aa  106  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  22.17 
 
 
687 aa  106  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  22.14 
 
 
686 aa  105  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  23.9 
 
 
684 aa  104  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  23.32 
 
 
678 aa  104  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  22.52 
 
 
685 aa  103  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  20.49 
 
 
690 aa  103  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  23.7 
 
 
701 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  24.78 
 
 
663 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  22.22 
 
 
687 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  23.96 
 
 
686 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  24.52 
 
 
660 aa  102  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  24.78 
 
 
663 aa  102  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  22.1 
 
 
711 aa  101  4e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  21.26 
 
 
686 aa  101  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  22 
 
 
644 aa  100  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.22 
 
 
700 aa  99.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  22.78 
 
 
706 aa  98.6  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  21.9 
 
 
679 aa  99  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  22.51 
 
 
687 aa  98.6  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  20.7 
 
 
688 aa  99  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  20.78 
 
 
669 aa  98.6  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  24.78 
 
 
664 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  24.78 
 
 
664 aa  98.2  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  23.48 
 
 
664 aa  98.2  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  24.78 
 
 
664 aa  97.8  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  23.89 
 
 
660 aa  97.4  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  24.65 
 
 
632 aa  97.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  25.36 
 
 
714 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  23.32 
 
 
686 aa  95.1  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  24.95 
 
 
635 aa  94  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  24.85 
 
 
656 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  24.85 
 
 
656 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  23.33 
 
 
671 aa  93.2  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1009  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  21.55 
 
 
667 aa  92  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  22.99 
 
 
661 aa  92  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  22.3 
 
 
710 aa  91.3  6e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  25.24 
 
 
677 aa  90.9  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  22.92 
 
 
645 aa  89.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  22.15 
 
 
693 aa  88.6  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  24.18 
 
 
653 aa  88.2  5e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  24.11 
 
 
682 aa  88.2  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  21.87 
 
 
711 aa  86.3  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  23.9 
 
 
685 aa  85.5  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  23.72 
 
 
656 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  23.93 
 
 
656 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  21.55 
 
 
701 aa  84.3  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  22.07 
 
 
663 aa  82.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  22.7 
 
 
681 aa  82  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  23.11 
 
 
646 aa  80.1  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  22.4 
 
 
652 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  22.3 
 
 
678 aa  79  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  21.34 
 
 
701 aa  78.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  22.65 
 
 
671 aa  76.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  23.25 
 
 
669 aa  75.1  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  21.68 
 
 
674 aa  74.3  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  19.9 
 
 
671 aa  73.6  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  24.74 
 
 
657 aa  73.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  22.11 
 
 
710 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  22.65 
 
 
710 aa  70.1  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1790  glycoside hydrolase family protein  23.44 
 
 
627 aa  64.7  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  21.38 
 
 
642 aa  63.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  25.1 
 
 
699 aa  61.6  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0463  hypothetical protein  26.15 
 
 
818 aa  58.2  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.177436 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>