100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3380 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  100 
 
 		 699 aa  1442    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  24.31 
 
 		 715 aa  190  5.999999999999999e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  26.14 
 
 		 701 aa  147  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 682 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  22.5 
 
 		 672 aa  127  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24.19 
 
 		 713 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  22.69 
 
 		 687 aa  120  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  25.36 
 
 		 682 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  22.73 
 
 		 663 aa  116  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  23.23 
 
 		 686 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  23.13 
 
 		 701 aa  114  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  22.97 
 
 		 685 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  22.65 
 
 		 687 aa  110  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  25.51 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  22.82 
 
 		 669 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  22.35 
 
 		 711 aa  108  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  24.14 
 
 		 685 aa  108  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  23.25 
 
 		 685 aa  107  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  23.2 
 
 		 686 aa  107  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24.21 
 
 		 700 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  27.68 
 
 		 661 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  22.92 
 
 		 710 aa  104  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  27.68 
 
 		 663 aa  104  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  22.3 
 
 		 687 aa  103  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  23.63 
 
 		 657 aa  103  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  23.45 
 
 		 652 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  25.53 
 
 		 697 aa  103  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  23.09 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  22.93 
 
 		 710 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  21.46 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  25.09 
 
 		 679 aa  102  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  23.78 
 
 		 644 aa  101  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  26.16 
 
 		 714 aa  101  5e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  23.16 
 
 		 672 aa  101  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  27.4 
 
 		 663 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  23.16 
 
 		 672 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  22.91 
 
 		 649 aa  99.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  28.01 
 
 		 660 aa  99.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  23.72 
 
 		 678 aa  99.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  27.4 
 
 		 664 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  23.09 
 
 		 669 aa  99  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  27.4 
 
 		 664 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  20.82 
 
 		 683 aa  98.6  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  26.52 
 
 		 663 aa  98.6  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  27.03 
 
 		 656 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  27.03 
 
 		 656 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  27.12 
 
 		 664 aa  98.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  27.63 
 
 		 660 aa  98.2  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  22.34 
 
 		 689 aa  97.8  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  23.43 
 
 		 680 aa  97.8  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  23.08 
 
 		 660 aa  95.9  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  22.19 
 
 		 689 aa  95.9  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  22.96 
 
 		 691 aa  94.7  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  23.14 
 
 		 688 aa  94.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  22.95 
 
 		 639 aa  94.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  24.3 
 
 		 697 aa  94  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  24.16 
 
 		 685 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  23.39 
 
 		 671 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  22.95 
 
 		 653 aa  92.4  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.54 
 
 		 686 aa  92  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  22.54 
 
 		 690 aa  92  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  21.94 
 
 		 685 aa  90.9  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  24.23 
 
 		 670 aa  90.5  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  24.09 
 
 		 706 aa  90.5  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  23.95 
 
 		 677 aa  90.9  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  23.64 
 
 		 677 aa  90.5  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  24.68 
 
 		 645 aa  90.1  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  25.41 
 
 		 656 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  24.23 
 
 		 642 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  21.97 
 
 		 701 aa  89.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  25.41 
 
 		 656 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  22.64 
 
 		 667 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  23.78 
 
 		 684 aa  87  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  22.81 
 
 		 671 aa  86.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  22.84 
 
 		 672 aa  86.3  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  24.03 
 
 		 681 aa  85.5  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  19.88 
 
 		 669 aa  85.1  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  24.93 
 
 		 664 aa  84.7  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  21.9 
 
 		 693 aa  84  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  21.94 
 
 		 710 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  25.06 
 
 		 673 aa  81.6  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  23.31 
 
 		 678 aa  81.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  24.66 
 
 		 635 aa  80.1  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  24.46 
 
 		 635 aa  79.7  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  23.77 
 
 		 632 aa  78.2  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  26.81 
 
 		 646 aa  78.6  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  21 
 
 		 686 aa  78.6  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  22.04 
 
 		 609 aa  77.8  0.0000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  22.88 
 
 		 657 aa  77.8  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  22.69 
 
 		 686 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  22.69 
 
 		 686 aa  77.4  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  20.29 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  22.8 
 
 		 711 aa  77  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  22.42 
 
 		 686 aa  74.7  0.000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  26.67 
 
 		 662 aa  69.3  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  22.52 
 
 		 699 aa  62.4  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1009  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  20.04 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  18.69 
 
 		 671 aa  55.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  22.76 
 
 		 672 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4433  hypothetical protein  24 
 
 		 1088 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0682487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>