100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1316 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  53.5 
 
 
667 aa  642    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  63.66 
 
 
686 aa  845    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  100 
 
 
678 aa  1356    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  51.05 
 
 
663 aa  592  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  47.19 
 
 
701 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  45.81 
 
 
677 aa  542  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  45.47 
 
 
682 aa  528  1e-148  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  45.31 
 
 
682 aa  523  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  44.8 
 
 
671 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  43 
 
 
701 aa  509  1e-143  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  44.81 
 
 
639 aa  504  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  43.65 
 
 
671 aa  502  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  45.97 
 
 
684 aa  499  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  41.19 
 
 
687 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  42.35 
 
 
685 aa  491  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  44.08 
 
 
678 aa  492  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  44.89 
 
 
681 aa  486  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  43.03 
 
 
663 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  43.42 
 
 
657 aa  478  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  45.91 
 
 
697 aa  478  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  43.37 
 
 
660 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  44.06 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  38.47 
 
 
687 aa  467  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  42.53 
 
 
685 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  37.54 
 
 
672 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  41.44 
 
 
697 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  43.97 
 
 
653 aa  455  1.0000000000000001e-126  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  39.69 
 
 
711 aa  448  1.0000000000000001e-124  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  42.71 
 
 
662 aa  443  1e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  41.57 
 
 
667 aa  437  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  33.24 
 
 
679 aa  420  1e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  37.92 
 
 
669 aa  411  1e-113  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  32.13 
 
 
683 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  33.19 
 
 
687 aa  392  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  36.43 
 
 
688 aa  388  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  33.33 
 
 
686 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  34.14 
 
 
685 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  35.14 
 
 
710 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  33.09 
 
 
686 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  33.33 
 
 
686 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  40.46 
 
 
686 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  35.2 
 
 
691 aa  371  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  32.74 
 
 
685 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  37.14 
 
 
686 aa  364  3e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  36.97 
 
 
679 aa  359  9.999999999999999e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  37.94 
 
 
706 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  31.35 
 
 
686 aa  353  7e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  37.17 
 
 
677 aa  352  1e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  29.31 
 
 
689 aa  349  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  30.53 
 
 
672 aa  348  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  29.46 
 
 
689 aa  348  2e-94  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  30.53 
 
 
672 aa  347  3e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  32.13 
 
 
672 aa  343  5e-93  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  32.75 
 
 
690 aa  333  4e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  27.53 
 
 
683 aa  298  3e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  29.46 
 
 
685 aa  296  1e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  31.38 
 
 
669 aa  293  7e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  30.53 
 
 
649 aa  272  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  32.55 
 
 
664 aa  270  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  30.38 
 
 
649 aa  269  1e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  33.04 
 
 
670 aa  265  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  31.21 
 
 
700 aa  261  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  30.3 
 
 
644 aa  258  3e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  32.12 
 
 
642 aa  254  3e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  32.18 
 
 
645 aa  252  1e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  31.86 
 
 
635 aa  250  7e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  27.9 
 
 
609 aa  249  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  35.24 
 
 
714 aa  249  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  31.65 
 
 
711 aa  246  8e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  29.83 
 
 
652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  32.88 
 
 
656 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  32.88 
 
 
656 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  27.83 
 
 
710 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  31.5 
 
 
646 aa  238  4e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  30.94 
 
 
664 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  30.97 
 
 
664 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  30.97 
 
 
664 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  30.58 
 
 
656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  29.84 
 
 
663 aa  233  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  30.01 
 
 
663 aa  231  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  27.09 
 
 
710 aa  232  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  30.57 
 
 
673 aa  230  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  30.64 
 
 
661 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  31.46 
 
 
656 aa  229  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  30.2 
 
 
660 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  31.28 
 
 
635 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  29.01 
 
 
632 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  29.15 
 
 
660 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  25.25 
 
 
701 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  27.21 
 
 
657 aa  208  2e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  27.49 
 
 
693 aa  196  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  23.66 
 
 
674 aa  189  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  22.68 
 
 
671 aa  185  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  25.17 
 
 
669 aa  183  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  27.12 
 
 
699 aa  163  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  23.72 
 
 
699 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  22.26 
 
 
715 aa  95.1  3e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  25.56 
 
 
713 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5083  hypothetical protein  25.82 
 
 
715 aa  48.1  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365257  normal  0.435002 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01626  beta-galactosidase  29.52 
 
 
613 aa  45.1  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.453001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>