100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2642 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  49.78 
 
 		 687 aa  688    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  48.47 
 
 		 688 aa  637    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  100 
 
 		 669 aa  1379    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  46.11 
 
 		 679 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  46.06 
 
 		 689 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  45.77 
 
 		 689 aa  655    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  48.1 
 
 		 686 aa  677    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  47.81 
 
 		 683 aa  689    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  45.01 
 
 		 686 aa  623  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  45.01 
 
 		 685 aa  621  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  44.57 
 
 		 685 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  43.12 
 
 		 672 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  47.95 
 
 		 679 aa  593  1e-168  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  46.47 
 
 		 686 aa  591  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  44.05 
 
 		 686 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  44.05 
 
 		 686 aa  589  1e-167  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  42.11 
 
 		 672 aa  578  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  46.17 
 
 		 706 aa  575  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  42.11 
 
 		 672 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  45.79 
 
 		 677 aa  567  1e-160  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  41.6 
 
 		 672 aa  560  1e-158  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  43.05 
 
 		 690 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  37.52 
 
 		 683 aa  507  9.999999999999999e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  39.88 
 
 		 663 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  39.85 
 
 		 687 aa  475  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  40.03 
 
 		 697 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  41.08 
 
 		 639 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  42.83 
 
 		 653 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  43.44 
 
 		 660 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  40.72 
 
 		 680 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  41.31 
 
 		 667 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  39.85 
 
 		 677 aa  440  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  38.43 
 
 		 685 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  39.1 
 
 		 657 aa  436  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  39.56 
 
 		 682 aa  432  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  39.64 
 
 		 662 aa  427  1e-118  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  38.43 
 
 		 682 aa  427  1e-118  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  38.96 
 
 		 671 aa  419  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  36.92 
 
 		 701 aa  420  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  40.3 
 
 		 697 aa  422  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  39.54 
 
 		 671 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  38.93 
 
 		 711 aa  419  9.999999999999999e-116  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  41.31 
 
 		 667 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  39.19 
 
 		 685 aa  412  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  45.08 
 
 		 701 aa  409  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  37.59 
 
 		 684 aa  399  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  37.92 
 
 		 678 aa  393  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  34.93 
 
 		 691 aa  386  1e-106  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  36.95 
 
 		 686 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  33.67 
 
 		 687 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  37.81 
 
 		 678 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  38.96 
 
 		 681 aa  383  1e-105  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  38.53 
 
 		 663 aa  381  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  37.85 
 
 		 686 aa  356  5.999999999999999e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  34.33 
 
 		 670 aa  343  7e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  32.35 
 
 		 669 aa  333  8e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  30.75 
 
 		 685 aa  330  6e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  32.49 
 
 		 710 aa  324  4e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  33.13 
 
 		 664 aa  309  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  32.47 
 
 		 700 aa  303  8.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  31.47 
 
 		 644 aa  302  1e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  29.85 
 
 		 657 aa  292  2e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  30.4 
 
 		 649 aa  292  2e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  30.25 
 
 		 649 aa  288  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  31.5 
 
 		 656 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  29.72 
 
 		 609 aa  269  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  29.28 
 
 		 646 aa  263  8.999999999999999e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  30.62 
 
 		 645 aa  261  4e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  34.97 
 
 		 714 aa  261  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  33.46 
 
 		 656 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  33.46 
 
 		 656 aa  259  9e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  30.24 
 
 		 656 aa  257  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  30.17 
 
 		 642 aa  256  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  28.59 
 
 		 660 aa  250  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  28.87 
 
 		 652 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  26.56 
 
 		 660 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  29.69 
 
 		 663 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  28.59 
 
 		 661 aa  244  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  29.88 
 
 		 663 aa  242  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  27.98 
 
 		 632 aa  241  2.9999999999999997e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  27.72 
 
 		 635 aa  239  1e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  29.34 
 
 		 635 aa  237  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  32.83 
 
 		 664 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  32.83 
 
 		 664 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  32.83 
 
 		 664 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  29.81 
 
 		 673 aa  237  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  28.15 
 
 		 711 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  24.3 
 
 		 701 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 710 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  25.59 
 
 		 710 aa  200  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  27.64 
 
 		 693 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  23.98 
 
 		 674 aa  193  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  23.75 
 
 		 669 aa  187  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  22.45 
 
 		 671 aa  186  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  26.51 
 
 		 699 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  23.72 
 
 		 713 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  20.78 
 
 		 715 aa  98.6  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  23.09 
 
 		 699 aa  99  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2409  hypothetical protein  24.7 
 
 		 690 aa  48.1  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.723522  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2959  glycoside hydrolase family 42 protein  24.26 
 
 		 571 aa  43.9  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>