104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2516 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  100 
 
 
670 aa  1309    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  40 
 
 
669 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  36.63 
 
 
649 aa  384  1e-105  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  36.63 
 
 
649 aa  383  1e-105  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  34.03 
 
 
685 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  38.41 
 
 
700 aa  369  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  31.4 
 
 
672 aa  349  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  34.33 
 
 
669 aa  343  7e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  37.69 
 
 
644 aa  337  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  36.63 
 
 
664 aa  335  2e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  31.79 
 
 
679 aa  333  7.000000000000001e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  31.15 
 
 
672 aa  326  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  36.24 
 
 
657 aa  326  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  31.15 
 
 
672 aa  325  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  36.94 
 
 
673 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  30.6 
 
 
687 aa  324  4e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  36.7 
 
 
656 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  36.7 
 
 
656 aa  321  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  33.43 
 
 
688 aa  321  3e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  37.87 
 
 
646 aa  320  5e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  34.66 
 
 
660 aa  320  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  38.74 
 
 
645 aa  317  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  33.97 
 
 
663 aa  314  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  36.74 
 
 
639 aa  313  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  33.33 
 
 
652 aa  312  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  34.72 
 
 
642 aa  312  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  35.36 
 
 
680 aa  312  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  36.76 
 
 
667 aa  312  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  34.01 
 
 
660 aa  310  4e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  29.39 
 
 
689 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  29.39 
 
 
689 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  30.97 
 
 
685 aa  303  6.000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  34.1 
 
 
657 aa  303  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  34.86 
 
 
656 aa  302  1e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  27.79 
 
 
683 aa  300  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  35.43 
 
 
660 aa  300  6e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  30.24 
 
 
686 aa  298  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  34.26 
 
 
663 aa  297  4e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  29.05 
 
 
686 aa  297  4e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  32.63 
 
 
685 aa  297  4e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  38.14 
 
 
714 aa  296  6e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  31.52 
 
 
690 aa  296  7e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  35.17 
 
 
656 aa  294  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  32.49 
 
 
697 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  37.46 
 
 
662 aa  293  8e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  34.15 
 
 
663 aa  293  9e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  34.92 
 
 
711 aa  291  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  34.41 
 
 
679 aa  291  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  33.75 
 
 
661 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  36.98 
 
 
664 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  36.98 
 
 
664 aa  289  9e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  27.1 
 
 
672 aa  289  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  26.66 
 
 
683 aa  288  2e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  36.78 
 
 
664 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  34.01 
 
 
706 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  36.48 
 
 
635 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  32.66 
 
 
686 aa  287  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  35.8 
 
 
635 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  35.17 
 
 
685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  31.76 
 
 
687 aa  283  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  32.59 
 
 
711 aa  283  1e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  36.06 
 
 
678 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  34.87 
 
 
682 aa  281  3e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  36.4 
 
 
684 aa  281  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  29.91 
 
 
686 aa  281  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  29.91 
 
 
686 aa  281  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  33.33 
 
 
685 aa  275  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  34.18 
 
 
682 aa  273  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  34.57 
 
 
677 aa  272  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  31.84 
 
 
687 aa  271  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  35.02 
 
 
697 aa  272  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  30.45 
 
 
609 aa  268  2e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  33.02 
 
 
632 aa  268  2.9999999999999995e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  26.7 
 
 
701 aa  266  8.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  31.07 
 
 
686 aa  265  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  33.04 
 
 
678 aa  261  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  34.48 
 
 
653 aa  262  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  35.08 
 
 
663 aa  259  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  34.49 
 
 
677 aa  258  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  29.66 
 
 
710 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  33.59 
 
 
667 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  34.82 
 
 
701 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  25.7 
 
 
671 aa  250  5e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  29.73 
 
 
710 aa  250  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  33.68 
 
 
681 aa  250  7e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  32.49 
 
 
701 aa  249  8e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  32.81 
 
 
671 aa  248  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  33.39 
 
 
686 aa  243  9e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  32.08 
 
 
671 aa  238  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  29.4 
 
 
669 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  31.51 
 
 
693 aa  229  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  25.33 
 
 
674 aa  224  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  27.09 
 
 
691 aa  214  4.9999999999999996e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  27.99 
 
 
710 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  29.2 
 
 
699 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  24.02 
 
 
715 aa  121  3.9999999999999996e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  25.94 
 
 
713 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24.23 
 
 
699 aa  90.5  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2556  hypothetical protein  21.85 
 
 
1137 aa  49.7  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  29.2 
 
 
439 aa  46.6  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>