98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5742 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  59.66 
 
 		 645 aa  768    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  54.02 
 
 		 664 aa  669    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  50.92 
 
 		 657 aa  667    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  52.79 
 
 		 649 aa  682    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  51.37 
 
 		 661 aa  641    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  53.32 
 
 		 664 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  52.79 
 
 		 649 aa  681    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  52.8 
 
 		 664 aa  637    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  52.66 
 
 		 663 aa  657    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  52.35 
 
 		 663 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  50.91 
 
 		 660 aa  657    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  53.58 
 
 		 660 aa  683    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  53.32 
 
 		 664 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  100 
 
 		 642 aa  1321    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  57.19 
 
 		 646 aa  734    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  51.99 
 
 		 656 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  51.99 
 
 		 656 aa  632  1e-180  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  51.38 
 
 		 656 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  50.6 
 
 		 673 aa  625  1e-177  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  51.22 
 
 		 656 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  50.24 
 
 		 635 aa  604  1.0000000000000001e-171  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  51.78 
 
 		 635 aa  599  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  51.61 
 
 		 632 aa  598  1e-170  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  40.7 
 
 		 669 aa  481  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  50.1 
 
 		 714 aa  476  1e-133  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  40.57 
 
 		 652 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  41.23 
 
 		 700 aa  449  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  37.12 
 
 		 609 aa  354  2e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  36.63 
 
 		 644 aa  342  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  36.2 
 
 		 653 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  32.37 
 
 		 672 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  31.16 
 
 		 679 aa  318  2e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  34.38 
 
 		 667 aa  317  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  34.72 
 
 		 670 aa  312  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  33.54 
 
 		 660 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 677 aa  303  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  32.42 
 
 		 685 aa  300  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  35.46 
 
 		 671 aa  298  2e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  33.08 
 
 		 682 aa  295  2e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  34.82 
 
 		 697 aa  293  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  33.59 
 
 		 639 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  33.69 
 
 		 663 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  34.08 
 
 		 680 aa  290  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  32.58 
 
 		 687 aa  289  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  36.88 
 
 		 686 aa  282  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  33.49 
 
 		 685 aa  280  7e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  33.28 
 
 		 687 aa  279  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  32.24 
 
 		 657 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  31.87 
 
 		 701 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  32.83 
 
 		 671 aa  266  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  32.94 
 
 		 697 aa  265  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  33.08 
 
 		 662 aa  265  2e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  32.4 
 
 		 684 aa  263  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  31.68 
 
 		 685 aa  261  2e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  30.97 
 
 		 678 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  30.17 
 
 		 669 aa  256  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  32.67 
 
 		 681 aa  251  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  29.22 
 
 		 685 aa  251  4e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  30.49 
 
 		 686 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  30.49 
 
 		 686 aa  250  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  34.02 
 
 		 710 aa  250  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  28.93 
 
 		 689 aa  250  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  31.19 
 
 		 679 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  28.76 
 
 		 689 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  28.78 
 
 		 686 aa  249  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  29.09 
 
 		 685 aa  247  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  32.06 
 
 		 682 aa  247  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  26.36 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  28.3 
 
 		 672 aa  244  5e-63  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  28.3 
 
 		 672 aa  244  5e-63  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  32.12 
 
 		 678 aa  243  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  28.61 
 
 		 672 aa  243  1e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  30.62 
 
 		 686 aa  242  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  29.67 
 
 		 688 aa  242  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  32.23 
 
 		 667 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  28.42 
 
 		 690 aa  240  5.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  32.5 
 
 		 711 aa  239  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  33.27 
 
 		 710 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  27.19 
 
 		 687 aa  236  8e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  29.54 
 
 		 686 aa  234  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  31.25 
 
 		 663 aa  234  3e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  32.7 
 
 		 711 aa  234  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  28.72 
 
 		 691 aa  233  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  31.71 
 
 		 701 aa  230  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  31.27 
 
 		 710 aa  229  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  30.04 
 
 		 677 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  31.46 
 
 		 706 aa  225  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  26.28 
 
 		 686 aa  219  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  27.65 
 
 		 701 aa  217  5.9999999999999996e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  25.44 
 
 		 683 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  24.82 
 
 		 671 aa  191  5e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  26.92 
 
 		 669 aa  171  5e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  26.8 
 
 		 693 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  23.49 
 
 		 674 aa  161  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  27.11 
 
 		 699 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24.23 
 
 		 699 aa  89  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24.85 
 
 		 713 aa  69.3  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  21.38 
 
 		 715 aa  63.2  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>