99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0160 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  51.16 
 
 		 686 aa  777    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  57.83 
 
 		 686 aa  870    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  46.06 
 
 		 669 aa  657    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  61.92 
 
 		 687 aa  940    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  51.16 
 
 		 686 aa  777    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  52.62 
 
 		 685 aa  791    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  51.81 
 
 		 685 aa  789    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  100 
 
 		 689 aa  1443    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  98.55 
 
 		 689 aa  1430    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  54.65 
 
 		 688 aa  813    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  52.47 
 
 		 686 aa  790    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  42.44 
 
 		 683 aa  583  1.0000000000000001e-165  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  41.01 
 
 		 679 aa  565  1e-160  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  41.01 
 
 		 683 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  36.84 
 
 		 672 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  37.37 
 
 		 672 aa  484  1e-135  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  38.1 
 
 		 679 aa  485  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  37.37 
 
 		 672 aa  484  1e-135  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  37.83 
 
 		 686 aa  482  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  36.89 
 
 		 672 aa  480  1e-134  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  36.4 
 
 		 706 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  37 
 
 		 697 aa  449  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  36.18 
 
 		 663 aa  442  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  34.43 
 
 		 690 aa  438  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  35.37 
 
 		 653 aa  427  1e-118  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  35 
 
 		 701 aa  424  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  35.04 
 
 		 677 aa  422  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  34.88 
 
 		 639 aa  414  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  36.67 
 
 		 660 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  34.99 
 
 		 677 aa  408  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  34.21 
 
 		 680 aa  406  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  34.75 
 
 		 687 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  32.61 
 
 		 687 aa  405  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  33.24 
 
 		 667 aa  402  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  35.55 
 
 		 685 aa  402  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  33.04 
 
 		 657 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  32.9 
 
 		 667 aa  396  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  34.31 
 
 		 682 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  32.76 
 
 		 678 aa  390  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 662 aa  381  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  33.53 
 
 		 682 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  31.13 
 
 		 685 aa  375  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  33.95 
 
 		 691 aa  370  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  32.75 
 
 		 684 aa  372  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  34.08 
 
 		 671 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  32.99 
 
 		 681 aa  369  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  33.53 
 
 		 697 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  33.88 
 
 		 671 aa  365  2e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  32.25 
 
 		 711 aa  355  2e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  30.59 
 
 		 701 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  29.08 
 
 		 686 aa  335  2e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  32.92 
 
 		 663 aa  334  4e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  30.76 
 
 		 669 aa  331  3e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  29.59 
 
 		 678 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  32.71 
 
 		 649 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  32.56 
 
 		 649 aa  312  2e-83  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  31.85 
 
 		 710 aa  310  4e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  34.54 
 
 		 686 aa  310  8e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  29.43 
 
 		 685 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  29.39 
 
 		 670 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  29.56 
 
 		 700 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  30.35 
 
 		 657 aa  256  8e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  27.54 
 
 		 664 aa  256  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  27.45 
 
 		 644 aa  254  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  28.76 
 
 		 642 aa  248  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  27.55 
 
 		 660 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  28.39 
 
 		 660 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  32.78 
 
 		 714 aa  239  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  26.18 
 
 		 663 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  26.9 
 
 		 661 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  26.01 
 
 		 673 aa  226  7e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  26.11 
 
 		 663 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  28.46 
 
 		 646 aa  224  4e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  26.65 
 
 		 671 aa  224  4e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  27.48 
 
 		 609 aa  223  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  29.4 
 
 		 635 aa  221  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  29.7 
 
 		 656 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  29.7 
 
 		 656 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  25.89 
 
 		 664 aa  219  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  28.12 
 
 		 656 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  27.13 
 
 		 710 aa  217  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  25.88 
 
 		 701 aa  216  9e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 664 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  25.75 
 
 		 664 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  25.9 
 
 		 711 aa  213  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  27.27 
 
 		 656 aa  213  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  27.13 
 
 		 645 aa  212  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  25.26 
 
 		 635 aa  212  2e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  26.71 
 
 		 710 aa  207  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  25.85 
 
 		 652 aa  207  6e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  28.63 
 
 		 632 aa  202  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  25.54 
 
 		 669 aa  194  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  25.28 
 
 		 693 aa  193  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  23.34 
 
 		 674 aa  172  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  23.41 
 
 		 699 aa  140  8.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  21.32 
 
 		 715 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  23.42 
 
 		 713 aa  97.4  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  22.19 
 
 		 699 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0885  hypothetical protein  23.36 
 
 		 808 aa  45.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145149  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>