108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5486 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  55.05 
 
 		 656 aa  669    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  92.77 
 
 		 664 aa  1183    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  98.64 
 
 		 663 aa  1327    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  56.21 
 
 		 656 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  55.05 
 
 		 656 aa  669    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  92.77 
 
 		 664 aa  1183    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  48.95 
 
 		 657 aa  642    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  52.57 
 
 		 664 aa  666    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  88.35 
 
 		 661 aa  1152    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  92.32 
 
 		 664 aa  1180    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  55.88 
 
 		 673 aa  696    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  100 
 
 		 663 aa  1345    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  55.3 
 
 		 656 aa  671    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  79.85 
 
 		 660 aa  1087    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  79.52 
 
 		 660 aa  1050    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  54.31 
 
 		 645 aa  684    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  52.81 
 
 		 642 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  53.26 
 
 		 646 aa  658    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  48.27 
 
 		 649 aa  624  1e-177  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  48.12 
 
 		 649 aa  621  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  50.53 
 
 		 632 aa  605  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  49.15 
 
 		 635 aa  588  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  50.54 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  53.07 
 
 		 714 aa  514  1e-144  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  41.85 
 
 		 652 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  40.27 
 
 		 669 aa  480  1e-134  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  41.62 
 
 		 700 aa  463  1e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  40.53 
 
 		 644 aa  362  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  32.7 
 
 		 685 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  32.44 
 
 		 609 aa  336  1e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  37.18 
 
 		 653 aa  333  6e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  32.94 
 
 		 667 aa  328  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  31.9 
 
 		 672 aa  321  3e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  35.96 
 
 		 660 aa  313  5.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  32.8 
 
 		 687 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  34.41 
 
 		 670 aa  308  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  29.73 
 
 		 679 aa  301  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  32.98 
 
 		 688 aa  298  3e-79  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  32.15 
 
 		 690 aa  293  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  32.51 
 
 		 657 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  34.36 
 
 		 684 aa  287  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  34.4 
 
 		 662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  30.21 
 
 		 685 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  30.38 
 
 		 686 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  30.38 
 
 		 686 aa  281  2e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  29.91 
 
 		 686 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  32.82 
 
 		 639 aa  280  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  32.07 
 
 		 677 aa  279  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  32.01 
 
 		 680 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  32.03 
 
 		 663 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  29.67 
 
 		 672 aa  278  3e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  35.34 
 
 		 679 aa  277  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  29.53 
 
 		 672 aa  276  7e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  36.21 
 
 		 701 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  31.57 
 
 		 687 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  34.11 
 
 		 671 aa  274  3e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  30.11 
 
 		 685 aa  270  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  33.86 
 
 		 671 aa  268  2e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  30.15 
 
 		 669 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  32.66 
 
 		 678 aa  267  5.999999999999999e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  34.05 
 
 		 686 aa  267  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  32.01 
 
 		 710 aa  266  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  33 
 
 		 697 aa  266  8e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  33.28 
 
 		 677 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  27.57 
 
 		 687 aa  265  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  32.09 
 
 		 711 aa  262  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  32.63 
 
 		 697 aa  263  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  32.85 
 
 		 710 aa  261  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  25.94 
 
 		 683 aa  260  6e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  32.89 
 
 		 706 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  37.74 
 
 		 681 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  31.23 
 
 		 682 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  28.92 
 
 		 672 aa  254  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  33.18 
 
 		 667 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  29.23 
 
 		 691 aa  253  9.000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  28.73 
 
 		 686 aa  248  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  26.32 
 
 		 689 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  26.18 
 
 		 689 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  31.74 
 
 		 686 aa  245  1.9999999999999999e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  31.26 
 
 		 711 aa  244  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  30.81 
 
 		 686 aa  243  7e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  32.46 
 
 		 685 aa  240  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  31.74 
 
 		 701 aa  238  3e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  30.89 
 
 		 663 aa  237  4e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  36.06 
 
 		 682 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  30.01 
 
 		 678 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  27.36 
 
 		 683 aa  228  3e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  29.89 
 
 		 685 aa  223  6e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  29.14 
 
 		 710 aa  223  7e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  26.49 
 
 		 701 aa  204  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  28.12 
 
 		 693 aa  168  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  22.78 
 
 		 671 aa  166  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  25.86 
 
 		 669 aa  163  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  25.96 
 
 		 699 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  24.44 
 
 		 674 aa  139  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  26.97 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  24.38 
 
 		 715 aa  107  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  27.4 
 
 		 699 aa  101  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2392  Beta-galactosidase  23.89 
 
 		 672 aa  54.7  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  32.46 
 
 		 433 aa  47.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>