101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6327 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  90.85 
 
 		 656 aa  1182    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  56.28 
 
 		 664 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  55.45 
 
 		 663 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  100 
 
 		 656 aa  1323    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  90.85 
 
 		 656 aa  1182    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  56.28 
 
 		 664 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  49.39 
 
 		 649 aa  641    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  52.23 
 
 		 664 aa  651    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  55.98 
 
 		 661 aa  684    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  49.7 
 
 		 649 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  55.52 
 
 		 664 aa  662    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  55.76 
 
 		 663 aa  677    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  96.65 
 
 		 656 aa  1251    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  54.71 
 
 		 660 aa  694    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  53.57 
 
 		 660 aa  665    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  51.38 
 
 		 642 aa  640    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  52.29 
 
 		 646 aa  662    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  53.51 
 
 		 645 aa  660    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  49.62 
 
 		 657 aa  630  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  50.94 
 
 		 673 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  48.73 
 
 		 635 aa  555  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  48.4 
 
 		 632 aa  533  1e-150  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  48.8 
 
 		 635 aa  524  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  52.3 
 
 		 714 aa  485  1e-136  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  40.69 
 
 		 652 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  40.6 
 
 		 669 aa  467  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  41.44 
 
 		 700 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  33.98 
 
 		 685 aa  360  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  36.71 
 
 		 653 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  35.46 
 
 		 644 aa  338  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  35.79 
 
 		 660 aa  333  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  35.43 
 
 		 657 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  33.06 
 
 		 609 aa  317  6e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  34.63 
 
 		 662 aa  313  4.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  33.83 
 
 		 663 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  35.46 
 
 		 670 aa  311  2e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  33.58 
 
 		 667 aa  309  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  32.88 
 
 		 687 aa  306  7e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  30.24 
 
 		 672 aa  301  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  34.37 
 
 		 701 aa  296  1e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  33.54 
 
 		 677 aa  295  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  35.26 
 
 		 680 aa  293  9e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  36.12 
 
 		 697 aa  291  3e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  34.93 
 
 		 671 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  34.21 
 
 		 639 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  28.45 
 
 		 679 aa  287  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  35.82 
 
 		 684 aa  287  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  31.5 
 
 		 669 aa  283  7.000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  37.89 
 
 		 681 aa  282  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  34.82 
 
 		 671 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  32.73 
 
 		 678 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  33.23 
 
 		 686 aa  275  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  32.43 
 
 		 697 aa  272  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  31.83 
 
 		 710 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  34.22 
 
 		 687 aa  266  8.999999999999999e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  31.69 
 
 		 679 aa  262  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  28.77 
 
 		 672 aa  261  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  28.77 
 
 		 672 aa  260  5.0000000000000005e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  28.99 
 
 		 685 aa  259  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  32.89 
 
 		 682 aa  258  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  30.1 
 
 		 685 aa  257  4e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  28.74 
 
 		 686 aa  257  4e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  33.6 
 
 		 711 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  32.59 
 
 		 667 aa  256  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  30.74 
 
 		 710 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  29.15 
 
 		 686 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  29.15 
 
 		 686 aa  253  8.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  30.8 
 
 		 691 aa  251  2e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  30.41 
 
 		 711 aa  251  2e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  30.27 
 
 		 682 aa  251  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  30.63 
 
 		 685 aa  247  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  31.65 
 
 		 710 aa  246  6.999999999999999e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  27.36 
 
 		 687 aa  245  1.9999999999999999e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  24.67 
 
 		 683 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  29.55 
 
 		 688 aa  243  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  29.01 
 
 		 690 aa  243  9e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  30.62 
 
 		 686 aa  241  2e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  33.09 
 
 		 701 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  30.03 
 
 		 685 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  26.32 
 
 		 683 aa  237  4e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  31.5 
 
 		 677 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  34.39 
 
 		 686 aa  236  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  25.63 
 
 		 672 aa  233  1e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  28.85 
 
 		 686 aa  232  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  28.12 
 
 		 689 aa  231  5e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  30.62 
 
 		 678 aa  229  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  27.82 
 
 		 689 aa  228  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  31.73 
 
 		 663 aa  228  3e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  33.33 
 
 		 706 aa  221  5e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  29.25 
 
 		 693 aa  206  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  26.24 
 
 		 701 aa  197  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  29.37 
 
 		 669 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  25.04 
 
 		 671 aa  173  7.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  24.07 
 
 		 674 aa  169  1e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  27.69 
 
 		 699 aa  156  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  27.57 
 
 		 713 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3380  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  23.61 
 
 		 699 aa  90.9  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  23.46 
 
 		 715 aa  86.7  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  39.22 
 
 		 891 aa  46.6  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2260  glycoside hydrolase family 5  46.3 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.445359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>