98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0845 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0845  Beta-galactosidase  100 
 
 
674 aa  1397    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1831  Beta-galactosidase  58.58 
 
 
671 aa  803    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2631  Beta-galactosidase  50.3 
 
 
701 aa  715    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.214804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2635  Beta-galactosidase  47.56 
 
 
669 aa  640    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34520  beta-galactosidase  45.14 
 
 
693 aa  621  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.313325  normal  0.443852 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11630  beta-galactosidase  29.53 
 
 
699 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.287124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0901  Beta-galactosidase  29.56 
 
 
685 aa  272  2e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.240206 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3892  Beta-galactosidase  27.65 
 
 
669 aa  230  6e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.113241  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2516  Beta-galactosidase  25.33 
 
 
670 aa  224  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0051  Beta-galactosidase  27.11 
 
 
663 aa  223  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1927  Beta-galactosidase  26.87 
 
 
679 aa  220  7.999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000283864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1623  Beta-galactosidase  26.24 
 
 
649 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.015305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2209  Beta-galactosidase  25.97 
 
 
711 aa  212  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0114104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1085  Beta-galactosidase  24.67 
 
 
672 aa  212  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1557  Beta-galactosidase  26.09 
 
 
649 aa  210  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.127402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0530  Beta-galactosidase  26.21 
 
 
672 aa  207  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3022  Beta-galactosidase  24.7 
 
 
653 aa  206  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2394  Beta-galactosidase  27.01 
 
 
645 aa  205  2e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5560  Beta-galactosidase  25.42 
 
 
667 aa  201  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.3655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2173  Beta-galactosidase  24.62 
 
 
660 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2451  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  24.74 
 
 
686 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.987943  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2868  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  27.06 
 
 
700 aa  200  6e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4935  Beta-galactosidase  25.94 
 
 
639 aa  199  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0997823  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0617  Beta-galactosidase  26.42 
 
 
677 aa  198  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2151  Beta-galactosidase  24.09 
 
 
685 aa  196  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.355264  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0918  beta-galactosidase  25.75 
 
 
686 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.995798  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0973  Beta-galactosidase  25.75 
 
 
686 aa  196  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.815982  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2642  Beta-galactosidase  23.98 
 
 
669 aa  193  9e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2891  Beta-galactosidase  24.42 
 
 
688 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0224405  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0607  Beta-galactosidase  24.34 
 
 
672 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00254825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03930  beta-galactosidase  25.77 
 
 
682 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0621  Beta-galactosidase  24.34 
 
 
672 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.627864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3076  Beta-galactosidase  24.04 
 
 
682 aa  185  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345923  normal  0.884247 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1064  Beta-galactosidase  23.62 
 
 
683 aa  184  3e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.113261  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2811  Beta-galactosidase  25.56 
 
 
646 aa  184  6e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.206861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1280  Beta-galactosidase  23.92 
 
 
685 aa  183  9.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00156008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06550  beta-galactosidase  24.71 
 
 
687 aa  183  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.753424  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33200  beta-galactosidase  24.86 
 
 
686 aa  183  9.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.105226  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2397  Beta-galactosidase  23.93 
 
 
690 aa  183  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421729  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2323  Beta-galactosidase  25.35 
 
 
710 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4676  Beta-galactosidase  23.41 
 
 
680 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.645626  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1615  beta-galactosidase  25.65 
 
 
663 aa  180  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0289359  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17050  beta-galactosidase  23.3 
 
 
686 aa  177  5e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172156  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3125  Beta-galactosidase  24.59 
 
 
671 aa  177  6e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0401597 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0378  Beta-galactosidase  23.7 
 
 
687 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946155  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03990  beta-galactosidase  24.21 
 
 
685 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1287  Beta-galactosidase  25.29 
 
 
701 aa  173  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.686384  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0160  beta-galactosidase  23.34 
 
 
689 aa  172  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3325  Beta-galactosidase  23.78 
 
 
671 aa  172  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0011475  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2144  Beta-galactosidase  25.71 
 
 
652 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.267505  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0156  beta-galactosidase  24.15 
 
 
689 aa  171  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2962  Beta-galactosidase  22.9 
 
 
685 aa  171  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000633248  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1938  Beta-galactosidase  22.54 
 
 
664 aa  170  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.949653  normal  0.422519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1316  Beta-galactosidase  23.66 
 
 
678 aa  170  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3322  Beta-galactosidase  22.46 
 
 
706 aa  170  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.511587  normal  0.0501254 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1005  beta-galactosidase  26.02 
 
 
710 aa  170  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.504738  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0311  Beta-galactosidase  23.93 
 
 
711 aa  169  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0181132  normal  0.0282735 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2648  Beta-galactosidase  23.71 
 
 
710 aa  169  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0829  Beta-galactosidase  23.02 
 
 
687 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000309351  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1976  Beta-galactosidase  23.82 
 
 
679 aa  169  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344903  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10120  beta-galactosidase  24.92 
 
 
697 aa  169  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0838655 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0505  Beta-galactosidase  21.97 
 
 
683 aa  169  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000103563  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0926  beta-galactosidase  25.14 
 
 
691 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0833623  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3298  Beta-galactosidase  23.31 
 
 
681 aa  165  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.452192  decreased coverage  0.00169341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1317  Beta-galactosidase  23.5 
 
 
686 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00129022  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0412  Beta-galactosidase  23.68 
 
 
662 aa  164  7e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.322295 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5742  beta-galactosidase  23.49 
 
 
642 aa  161  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.585873  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3288  Beta-galactosidase  24.02 
 
 
656 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4877  Beta-galactosidase  24.02 
 
 
656 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.713772  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06640  beta-galactosidase  23.33 
 
 
701 aa  158  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.639566  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7700  Beta-galactosidase  25.17 
 
 
667 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0520455  normal  0.819106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2736  Beta-galactosidase  23.42 
 
 
657 aa  157  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.174628  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3970  Beta-galactosidase  24.44 
 
 
678 aa  155  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.115571  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2028  Beta-galactosidase  23.54 
 
 
697 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.119513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1193  Beta-galactosidase  24.09 
 
 
684 aa  155  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.377483  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6327  Beta-galactosidase  24.07 
 
 
656 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1764  Beta-galactosidase  23.96 
 
 
686 aa  154  7e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00394177  normal  0.0245324 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6027  Beta-galactosidase  24.36 
 
 
656 aa  153  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.330349  normal  0.994275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1239  beta-galactosidase  24.76 
 
 
635 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.527812  normal  0.0426112 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0419  Beta-galactosidase  25.71 
 
 
609 aa  151  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2829  Beta-galactosidase  24.41 
 
 
714 aa  150  5e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.130721  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3638  Beta-galactosidase  23.69 
 
 
644 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3245  Beta-galactosidase  24.45 
 
 
673 aa  145  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2995  Beta-galactosidase  21.9 
 
 
677 aa  143  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3492  Beta-galactosidase  23.43 
 
 
635 aa  138  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3830  Beta-galactosidase  24.31 
 
 
632 aa  127  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247674  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2015  Beta-galactosidase  22.01 
 
 
657 aa  124  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000219156  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2352  Beta-galactosidase  23.77 
 
 
660 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0870691  normal  0.136979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5202  Beta-galactosidase  24.87 
 
 
664 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.856038  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4585  Beta-galactosidase  22.53 
 
 
660 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5657  Beta-galactosidase  24.87 
 
 
664 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00663858  normal  0.40275 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3197  Beta-galactosidase  22.37 
 
 
661 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271106  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4931  Beta-galactosidase  24.25 
 
 
663 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0648611 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5486  Beta-galactosidase  24.25 
 
 
663 aa  120  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761989  hitchhiker  0.000330975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4578  Beta-galactosidase  25.13 
 
 
664 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144299 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0080  glycoside hydrolase family 42 protein  21.68 
 
 
715 aa  74.3  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0820956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5076  Glycoside hydrolase family 42 domain protein  21.47 
 
 
713 aa  73.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946735  normal  0.386552 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2556  hypothetical protein  21.66 
 
 
1137 aa  54.7  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>