72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3004 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 442 aa  892    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  95.48 
 
 		 442 aa  840    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  55.24 
 
 		 444 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  52.68 
 
 		 437 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  54.15 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  50.98 
 
 		 444 aa  409  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  29.48 
 
 		 891 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.57 
 
 		 602 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  26.82 
 
 		 534 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.81 
 
 		 604 aa  110  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.55 
 
 		 803 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.21 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.21 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.21 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  29.1 
 
 		 398 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  31.58 
 
 		 801 aa  94.4  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  26.7 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  26.7 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  26.7 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  27.44 
 
 		 450 aa  92.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  27.38 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  27.16 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  24.32 
 
 		 340 aa  82.8  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  24.44 
 
 		 614 aa  81.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  23.89 
 
 		 605 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.62 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  23.1 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  24.43 
 
 		 1276 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.23 
 
 		 584 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  25.28 
 
 		 447 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  25.64 
 
 		 453 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  23.34 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  25.07 
 
 		 596 aa  71.2  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.6 
 
 		 408 aa  70.5  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  24.84 
 
 		 873 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  20.98 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.5 
 
 		 586 aa  60.8  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.49 
 
 		 662 aa  60.8  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  23.76 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  25.99 
 
 		 601 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  25.98 
 
 		 601 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  23.27 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  28.25 
 
 		 640 aa  55.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  24.92 
 
 		 596 aa  54.3  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  24.09 
 
 		 1141 aa  53.9  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3846  hypothetical protein  23.39 
 
 		 314 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  23.85 
 
 		 597 aa  53.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  28.17 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  24.05 
 
 		 562 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  22.56 
 
 		 600 aa  50.4  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  21.26 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  22.76 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  25.34 
 
 		 312 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  25.34 
 
 		 312 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  25.71 
 
 		 468 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 1025 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.19 
 
 		 1086 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  20.6 
 
 		 426 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  23.15 
 
 		 460 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  25.23 
 
 		 311 aa  45.8  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  21.79 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  21.78 
 
 		 550 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  24.77 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  21.43 
 
 		 446 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  25.87 
 
 		 392 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3601  hypothetical protein  38.67 
 
 		 465 aa  43.5  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  24.3 
 
 		 457 aa  43.5  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4248  hypothetical protein  24.4 
 
 		 333 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0450926 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>