44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3728 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3728  peptidase C60, sortase A and B  100 
 
 		 244 aa  479  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3681  peptidase C60 sortase A and B  74.15 
 
 		 243 aa  327  1.0000000000000001e-88  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.464105  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0208  peptidase C60 sortase A and B  43.65 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.784378  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1131  peptidase C60 sortase A and B  50.92 
 
 		 238 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.019865 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  59.72 
 
 		 384 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  61.11 
 
 		 375 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4170  sortase family protein  35.14 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.578913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1357  sortase family protein  34.91 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0136  peptidase C60 sortase A and B  32.8 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.765085  hitchhiker  0.000446536 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0567  peptidase C60 sortase A and B  34.62 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3119  peptidase C60, sortase A and B  29.21 
 
 		 302 aa  62  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000120301  unclonable  0.0000160759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4117  peptidase C60 sortase A and B  36.17 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2959  peptidase C60 sortase A and B  30.14 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0608881  hitchhiker  0.000198401 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4659  peptidase C60 sortase A and B  33.86 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4636  peptidase C60 sortase A and B  30.43 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.206736  normal  0.403037 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  32.43 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4642  sortase family protein  32.45 
 
 		 302 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.068472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3604  peptidase C60, sortase A and B  34.68 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.126497 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5062  sortase family protein  33.33 
 
 		 241 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000275463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0916  putative secreted protein  34.31 
 
 		 188 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.998693  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3106  peptidase C60 sortase A and B  30.95 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.474444  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1017  hypothetical protein  27.61 
 
 		 284 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  46.67 
 
 		 846 aa  49.3  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3316  peptidase C60 sortase A and B  29.49 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0348  peptidase C60, sortase A and B  34.9 
 
 		 214 aa  48.9  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0108508 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0528  peptidase C60 sortase A and B  37.11 
 
 		 368 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0135812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  34.29 
 
 		 1281 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0530  peptidase C60 sortase A and B  33.07 
 
 		 298 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0197121 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3985  peptidase C60 sortase A and B  32.74 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.136335  hitchhiker  0.00273946 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0056  sortase family protein  31.45 
 
 		 556 aa  46.6  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.761592 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  34.25 
 
 		 840 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3111  sortase family protein  32.14 
 
 		 298 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0428  peptidase C60 sortase A and B  27.03 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.992897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1793  peptidase C60 sortase A and B  30.73 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000420005  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0141  peptidase C60 sortase A and B  34.11 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0051  sortase family protein  31.06 
 
 		 521 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.447645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1664  peptidase C60, sortase A and B  31.91 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0338  peptidase C60, sortase A and B  29.11 
 
 		 207 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1460  peptidase C60, sortase A and B  37.11 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.20408  decreased coverage  0.00772893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1612  Pectate lyase/Amb allergen  46.67 
 
 		 1409 aa  43.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5708  peptidase C60 sortase A and B  30.53 
 
 		 167 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0809  hypothetical protein  46.38 
 
 		 916 aa  42.7  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.455366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1112  hypothetical protein  30.86 
 
 		 192 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773264  normal  0.429356 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31940  sortase family enzyme  31.98 
 
 		 260 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0575864  normal  0.194015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>