114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1063 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 398 aa  795    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  36.47 
 
 		 415 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  32.7 
 
 		 340 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  33.33 
 
 		 602 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  31.83 
 
 		 604 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  31.37 
 
 		 891 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  29.1 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  30.89 
 
 		 534 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  28.48 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  30.79 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  30.79 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  30.79 
 
 		 450 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  30.38 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  30.38 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  30.38 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  30.38 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  30.38 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  30.38 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  30.38 
 
 		 442 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  26.52 
 
 		 408 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  31.82 
 
 		 801 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  27.64 
 
 		 444 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  31.82 
 
 		 803 aa  96.3  9e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  29.08 
 
 		 450 aa  93.2  7e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  33.7 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  25.46 
 
 		 510 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  25.46 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  25.46 
 
 		 510 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  27.78 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  25.52 
 
 		 558 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  25.23 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  25.23 
 
 		 510 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  28.1 
 
 		 1276 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  25.88 
 
 		 444 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  27.01 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.28 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  27.55 
 
 		 662 aa  79.7  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.95 
 
 		 1141 aa  79.7  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  27.58 
 
 		 460 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  28.17 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  31.62 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  27.5 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  26.01 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  25.52 
 
 		 425 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  24.78 
 
 		 461 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  23.28 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  24.89 
 
 		 436 aa  73.2  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  25.25 
 
 		 437 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  26.85 
 
 		 481 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.93 
 
 		 437 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  24.26 
 
 		 550 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  30.94 
 
 		 605 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  27.01 
 
 		 468 aa  67  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.63 
 
 		 685 aa  67  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  25.68 
 
 		 482 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  23.49 
 
 		 326 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  23.1 
 
 		 544 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.07 
 
 		 684 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.92 
 
 		 680 aa  65.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  25.67 
 
 		 1025 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  26.32 
 
 		 448 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 669 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  27.35 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  23.46 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25 
 
 		 586 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  21.39 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  25.32 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.16 
 
 		 600 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  28.64 
 
 		 614 aa  63.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  27.97 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  23.76 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  25.46 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.59 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  28.73 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.16 
 
 		 672 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  25.54 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  23.48 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.48 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  23.15 
 
 		 508 aa  57.4  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.28 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  25.88 
 
 		 307 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  34.25 
 
 		 873 aa  54.7  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  26.91 
 
 		 310 aa  53.9  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  28.37 
 
 		 654 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5474  hypothetical protein  31.85 
 
 		 780 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.769605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  24.23 
 
 		 530 aa  53.1  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  21.47 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  26.13 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  26.46 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  23.84 
 
 		 601 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  27.23 
 
 		 501 aa  51.2  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  23.38 
 
 		 601 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  26.2 
 
 		 500 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  25.76 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01610  beta-1,4-xylanase  24.35 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  27.57 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  22.57 
 
 		 426 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  24.92 
 
 		 432 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  27.35 
 
 		 311 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>