41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0170 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 611 aa  1201    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3134  glycoside hydrolase family protein  33.63 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  33.18 
 
 		 530 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0187  glycoside hydrolase family 39  34.39 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0776  glycoside hydrolase family protein  31.38 
 
 		 523 aa  205  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33180  beta-xylosidase  38.11 
 
 		 520 aa  204  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0737494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1978  Xylan 1,4-beta-xylosidase  36.89 
 
 		 512 aa  204  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727016  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0184  Xylan 1,4-beta-xylosidase  32.39 
 
 		 501 aa  204  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1259  glycoside hydrolase family 39  30.86 
 
 		 501 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2997  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.15 
 
 		 514 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.864666 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1297  glycoside hydrolase family 39  28.82 
 
 		 523 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2705  glycoside hydrolase family 39  36.09 
 
 		 503 aa  200  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2398  Xylan 1,4-beta-xylosidase  37.57 
 
 		 519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.274955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2663  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.26 
 
 		 510 aa  190  5e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0370  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.26 
 
 		 509 aa  190  8e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.809464  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0820  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.15 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0114  glycoside hydrolase family 39  34.57 
 
 		 544 aa  182  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.747279  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3822  Xylan 1,4-beta-xylosidase  35.74 
 
 		 518 aa  180  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163293  normal  0.112071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7193  glycoside hydrolase family 39  30.68 
 
 		 548 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0114061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1539  glycoside hydrolase family 39  28.67 
 
 		 578 aa  132  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3952  glycoside hydrolase family 39  25.91 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3934  glycoside hydrolase family 39  26.8 
 
 		 576 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.346873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1362  glycoside hydrolase family protein  32.36 
 
 		 557 aa  119  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5268  glycoside hydrolase family 39  29.78 
 
 		 561 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1416  glycoside hydrolase family 39  26.96 
 
 		 557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.336596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5150  glycoside hydrolase family 39  27.87 
 
 		 566 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964315  hitchhiker  0.00110099 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2530  glycoside hydrolase family 39  26.74 
 
 		 864 aa  64.3  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  27.97 
 
 		 415 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0695  glycoside hydrolase family protein  24.36 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.251112  normal  0.0214921 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  28.48 
 
 		 398 aa  50.4  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  29.05 
 
 		 891 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  26.79 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  27.46 
 
 		 425 aa  47.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  36.03 
 
 		 1276 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  26.53 
 
 		 450 aa  47.4  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0657  hypothetical protein  24.47 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0632  hypothetical protein  24.47 
 
 		 809 aa  46.2  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  30.5 
 
 		 436 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3044  hypothetical protein  27.87 
 
 		 369 aa  44.3  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.139878  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1927  hypothetical protein  30.95 
 
 		 478 aa  43.9  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.968259  normal  0.177201 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>