45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1311 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  622  1e-177  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  82.99 
 
 		 312 aa  520  1e-147  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  83.33 
 
 		 312 aa  522  1e-147  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  81.97 
 
 		 312 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  81.29 
 
 		 310 aa  505  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  78.11 
 
 		 325 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  75.85 
 
 		 305 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  75.17 
 
 		 311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  74.49 
 
 		 311 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0877  hypothetical protein  69.05 
 
 		 294 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3223  hypothetical protein  69.9 
 
 		 289 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.226821  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0925  hypothetical protein  70.93 
 
 		 289 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0675759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0928  hypothetical protein  71.28 
 
 		 289 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  62.71 
 
 		 307 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.41 
 
 		 684 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.87 
 
 		 685 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.97 
 
 		 669 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 		 672 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 		 672 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.22 
 
 		 680 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.93 
 
 		 602 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.04 
 
 		 604 aa  67.4  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  27.44 
 
 		 534 aa  59.3  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.93 
 
 		 1276 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.66 
 
 		 803 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.24 
 
 		 415 aa  54.3  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  25.76 
 
 		 398 aa  50.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  31.03 
 
 		 801 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  21.77 
 
 		 326 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  28.23 
 
 		 450 aa  46.6  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  28.23 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  28.23 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  28.23 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  28.23 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  28.23 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  28.23 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  28.23 
 
 		 442 aa  45.8  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.5 
 
 		 450 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.5 
 
 		 450 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.5 
 
 		 450 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  23.7 
 
 		 460 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  26.92 
 
 		 444 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  26.96 
 
 		 891 aa  42.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  25.46 
 
 		 442 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.46 
 
 		 442 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>