42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3314 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  82.44 
 
 		 508 aa  837    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1012    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1027  hypothetical protein  44.91 
 
 		 464 aa  340  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  46.59 
 
 		 432 aa  324  3e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  33 
 
 		 654 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  28.27 
 
 		 481 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.09 
 
 		 1276 aa  80.1  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.85 
 
 		 803 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.92 
 
 		 801 aa  76.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.99 
 
 		 873 aa  67  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  24.94 
 
 		 596 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  24.74 
 
 		 584 aa  65.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  22.31 
 
 		 662 aa  64.3  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  23.72 
 
 		 1141 aa  62  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  27.23 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  27.23 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 510 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  26.75 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  27.57 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  27.19 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  24.08 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  26.5 
 
 		 891 aa  57.8  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.81 
 
 		 604 aa  57  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  25 
 
 		 605 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.69 
 
 		 602 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  28.64 
 
 		 1086 aa  54.3  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  25.58 
 
 		 415 aa  53.5  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  25.87 
 
 		 597 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  25.75 
 
 		 600 aa  52.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  29.47 
 
 		 369 aa  51.2  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  29.79 
 
 		 392 aa  48.5  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  25.94 
 
 		 564 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  22.78 
 
 		 437 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  25.36 
 
 		 596 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  23.89 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  29.07 
 
 		 372 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1124  hypothetical protein  33.85 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.762917  normal  0.353198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6489  hypothetical protein  33.85 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  28.4 
 
 		 446 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1398  hypothetical protein  28.37 
 
 		 760 aa  44.3  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.391538  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  24.55 
 
 		 340 aa  43.9  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>