31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0442 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  643    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  93.55 
 
 		 311 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  73.29 
 
 		 312 aa  478  1e-134  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  75 
 
 		 305 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  72.31 
 
 		 312 aa  472  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  73.36 
 
 		 310 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  72.31 
 
 		 312 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  74.49 
 
 		 303 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  74.49 
 
 		 325 aa  465  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3223  hypothetical protein  69.55 
 
 		 289 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.226821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0877  hypothetical protein  67.69 
 
 		 294 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0928  hypothetical protein  68.86 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0925  hypothetical protein  68.51 
 
 		 289 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0675759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  61.9 
 
 		 307 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 684 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.68 
 
 		 685 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 672 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 		 672 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.95 
 
 		 669 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 		 680 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.24 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.93 
 
 		 602 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25 
 
 		 1276 aa  57  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.67 
 
 		 604 aa  56.2  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.43 
 
 		 803 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  27.59 
 
 		 801 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.35 
 
 		 398 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  29.82 
 
 		 891 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.77 
 
 		 442 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  25.23 
 
 		 442 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25 
 
 		 340 aa  43.1  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>