30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0877 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0877  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  597  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0925  hypothetical protein  96.54 
 
 
289 aa  547  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0675759  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0928  hypothetical protein  96.19 
 
 
289 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3223  hypothetical protein  78.55 
 
 
289 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.226821  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  70.07 
 
 
305 aa  434  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  70.07 
 
 
325 aa  431  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  69.05 
 
 
303 aa  424  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  68.71 
 
 
312 aa  421  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  67.69 
 
 
311 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  69.05 
 
 
310 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  68.37 
 
 
312 aa  418  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  68.03 
 
 
311 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  68.37 
 
 
312 aa  417  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  63.61 
 
 
307 aa  395  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
685 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 
684 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
669 aa  90.1  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
672 aa  89  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.17 
 
 
672 aa  89  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.57 
 
 
680 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.38 
 
 
534 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.82 
 
 
1276 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  28.12 
 
 
602 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  29.38 
 
 
604 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  27.54 
 
 
803 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  22.75 
 
 
415 aa  50.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  28.5 
 
 
801 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.44 
 
 
614 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.54 
 
 
460 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  26.89 
 
 
444 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>