32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0928 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_0928  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  585  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0925  hypothetical protein  99.65 
 
 		 289 aa  583  1e-166  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0675759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0877  hypothetical protein  96.19 
 
 		 294 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3223  hypothetical protein  79.24 
 
 		 289 aa  457  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.226821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2690  hypothetical protein  70.59 
 
 		 305 aa  427  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  70.59 
 
 		 325 aa  427  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1311  hypothetical protein  71.28 
 
 		 303 aa  426  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.549363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  68.86 
 
 		 311 aa  421  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1260  hypothetical protein  70.59 
 
 		 310 aa  421  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0500  hypothetical protein  70.24 
 
 		 312 aa  420  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  69.55 
 
 		 312 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  69.2 
 
 		 311 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  69.55 
 
 		 312 aa  414  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  64.01 
 
 		 307 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.71 
 
 		 685 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 684 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 		 669 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 		 672 aa  89.7  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.56 
 
 		 672 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.41 
 
 		 680 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  28.7 
 
 		 534 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  32.5 
 
 		 602 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  31.25 
 
 		 604 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.45 
 
 		 1276 aa  55.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  28.5 
 
 		 803 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  23.94 
 
 		 415 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  28.5 
 
 		 801 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  25.79 
 
 		 614 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  26.7 
 
 		 605 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  27.03 
 
 		 398 aa  45.8  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  24.41 
 
 		 460 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  26.17 
 
 		 891 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>