167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2630 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  100 
 
 		 801 aa  1600    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  87.63 
 
 		 803 aa  1344    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  46.76 
 
 		 891 aa  559  1e-158  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  48.66 
 
 		 602 aa  521  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  47.98 
 
 		 604 aa  518  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  38.89 
 
 		 534 aa  356  1e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  61.29 
 
 		 455 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50.53 
 
 		 597 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  51.69 
 
 		 421 aa  185  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  54.89 
 
 		 384 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  49.52 
 
 		 400 aa  181  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  52.66 
 
 		 492 aa  180  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  53.8 
 
 		 375 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.28 
 
 		 638 aa  172  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  55.14 
 
 		 457 aa  171  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  52.97 
 
 		 340 aa  168  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  45.96 
 
 		 347 aa  159  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  44.66 
 
 		 653 aa  157  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  30.48 
 
 		 1276 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.83 
 
 		 689 aa  153  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  49.18 
 
 		 415 aa  152  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.2 
 
 		 688 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  48.62 
 
 		 338 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  35.33 
 
 		 596 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.63 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  42.99 
 
 		 451 aa  149  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  50 
 
 		 654 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  44.71 
 
 		 334 aa  147  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  32.15 
 
 		 584 aa  144  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  44.15 
 
 		 374 aa  142  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  43.92 
 
 		 374 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  61.29 
 
 		 281 aa  141  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  45.26 
 
 		 376 aa  140  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  44.92 
 
 		 345 aa  138  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  43.85 
 
 		 376 aa  138  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  40.11 
 
 		 662 aa  133  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  42.23 
 
 		 635 aa  129  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  42.72 
 
 		 642 aa  125  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  30.4 
 
 		 444 aa  126  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  43.33 
 
 		 235 aa  125  4e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  28.66 
 
 		 1141 aa  120  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  31 
 
 		 873 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  28.4 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  30.82 
 
 		 614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  35.53 
 
 		 480 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.41 
 
 		 396 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.89 
 
 		 413 aa  114  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  38.58 
 
 		 354 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  31.15 
 
 		 562 aa  111  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  30.21 
 
 		 554 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  31.64 
 
 		 442 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  28.09 
 
 		 444 aa  107  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  37.21 
 
 		 596 aa  108  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  29.81 
 
 		 442 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  30.97 
 
 		 340 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  29.35 
 
 		 437 aa  106  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  36.61 
 
 		 597 aa  105  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  34.7 
 
 		 600 aa  101  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  29.25 
 
 		 605 aa  101  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  35.16 
 
 		 601 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  36.02 
 
 		 362 aa  101  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1086 aa  100  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  28.4 
 
 		 415 aa  100  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  37.63 
 
 		 283 aa  99  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  28.92 
 
 		 564 aa  99  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  32.89 
 
 		 392 aa  98.6  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  34.13 
 
 		 1025 aa  97.4  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  31.82 
 
 		 398 aa  96.7  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  33.49 
 
 		 586 aa  95.1  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  33.79 
 
 		 601 aa  94.7  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  29.92 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  28.1 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  28.1 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  28.1 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  28.1 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  28.1 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  28.1 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  28.1 
 
 		 442 aa  93.2  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  36.71 
 
 		 350 aa  91.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  37.76 
 
 		 665 aa  91.3  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.92 
 
 		 450 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.92 
 
 		 450 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.92 
 
 		 450 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  37.31 
 
 		 656 aa  88.6  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  30.58 
 
 		 508 aa  87.8  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  33.52 
 
 		 459 aa  87.4  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  27.51 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.09 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  32.77 
 
 		 380 aa  85.1  0.000000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  30.27 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  25.98 
 
 		 550 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  28.52 
 
 		 436 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  26.99 
 
 		 434 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  26.42 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  27.31 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.88 
 
 		 376 aa  78.2  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  27.05 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  26.51 
 
 		 476 aa  78.2  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  31.47 
 
 		 372 aa  77.4  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  33.71 
 
 		 306 aa  77.4  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>