61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3736 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3736  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  826    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00729537  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0889  hypothetical protein  73.57 
 
 
421 aa  589  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.465797  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0894  hypothetical protein  71.27 
 
 
281 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.000012433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  49.52 
 
 
801 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  48.56 
 
 
803 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.54 
 
 
597 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.09 
 
 
688 aa  152  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.92 
 
 
689 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0340  hypothetical protein  42.86 
 
 
492 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00130161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3542  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.37 
 
 
638 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0100576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4116  Allergen V5/Tpx-1 family protein  41.47 
 
 
455 aa  140  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3485  SCP-like extracellular  45.88 
 
 
457 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0975  hypothetical protein  43.68 
 
 
340 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000499479  normal  0.0135476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4120  hypothetical protein  41.26 
 
 
374 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.897659  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0937  peptidase C60 sortase A and B  37.16 
 
 
384 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4282  peptidase C60, sortase A and B  37.39 
 
 
375 aa  123  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0813218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1305  hypothetical protein  39.81 
 
 
374 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.30538  normal  0.428296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2149  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.04 
 
 
722 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.70819  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  33.58 
 
 
662 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4678  hypothetical protein  38.81 
 
 
338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4214  hypothetical protein  37.93 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.278975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  35.69 
 
 
654 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1394  hypothetical protein  37.88 
 
 
415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3541  hypothetical protein  32.85 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000377942  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0268  SCP-like extracellular  36.67 
 
 
347 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0028  hypothetical protein  35.64 
 
 
376 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3540  hypothetical protein  37.88 
 
 
334 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000633057  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  37 
 
 
345 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1613  sortase family protein  35.22 
 
 
354 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1171  hypothetical protein  35.32 
 
 
235 aa  99  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000304249  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0994  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.89 
 
 
374 aa  97.8  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1902  sortase family protein  39.09 
 
 
350 aa  96.7  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0102426  normal  0.943943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2733  VanW family protein  33.33 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000046928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4294  hypothetical protein  34.93 
 
 
653 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.134506  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  33.91 
 
 
600 aa  89  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4295  hypothetical protein  34.15 
 
 
635 aa  83.6  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4296  hypothetical protein  33.66 
 
 
642 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1454  hypothetical protein  34.95 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000963301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1220  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.98 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.68044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4121  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.98 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1159  hypothetical protein  30.06 
 
 
665 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0383  hypothetical protein  30.06 
 
 
656 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.677432  normal  0.0348791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  32.3 
 
 
586 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  28.52 
 
 
601 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0780  hypothetical protein  35.15 
 
 
283 aa  72  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3744  hypothetical protein  31.31 
 
 
362 aa  69.7  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2878  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.91 
 
 
376 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.362697  normal  0.415622 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  32.26 
 
 
596 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2153  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.92 
 
 
398 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  47.5 
 
 
601 aa  67  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  31.8 
 
 
597 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4618  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.94 
 
 
370 aa  63.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00401863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3490  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.36 
 
 
397 aa  60.8  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4015  hypothetical protein  37.01 
 
 
306 aa  58.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3503  hypothetical protein  41.51 
 
 
131 aa  50.8  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2046  putative poly-gamma-glutamate biosynthesis (capsule formation)-like protein  27.49 
 
 
862 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000297905  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1576  peptidase domain-containing protein  36.96 
 
 
760 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.599229  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  35.71 
 
 
453 aa  49.7  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0935  peptidase domain-containing protein  34.15 
 
 
758 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  28 
 
 
500 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2358  hypothetical protein  27.82 
 
 
769 aa  45.8  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.916043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>