72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_35670 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  95.48 
 
 		 442 aa  840    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  100 
 
 		 442 aa  893    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  55.24 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  51.71 
 
 		 437 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3534  glycosyl hydrolase, family 5 PslG  53.66 
 
 		 437 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.648854  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  51.23 
 
 		 444 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  29.18 
 
 		 891 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.03 
 
 		 602 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.5 
 
 		 604 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  26.86 
 
 		 534 aa  110  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  27.3 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  27.3 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  27.3 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  29.25 
 
 		 803 aa  101  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  28.48 
 
 		 398 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  27.71 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  27.71 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  27.71 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  27.71 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  27.71 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  26.67 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  27.71 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  27.71 
 
 		 442 aa  92.8  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  29.24 
 
 		 801 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  24.51 
 
 		 340 aa  86.3  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  26.85 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  27.16 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  24.12 
 
 		 605 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  26.5 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  26 
 
 		 447 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.38 
 
 		 584 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.53 
 
 		 415 aa  77.8  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  23.47 
 
 		 614 aa  77.4  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  22.91 
 
 		 437 aa  74.7  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  23.58 
 
 		 1276 aa  74.7  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  25.6 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  22.83 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  24.59 
 
 		 596 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  26.57 
 
 		 601 aa  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  25.08 
 
 		 873 aa  62.4  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  23.4 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  21.26 
 
 		 476 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  24.93 
 
 		 586 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  26.57 
 
 		 601 aa  63.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  23.81 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  28.49 
 
 		 662 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  23.87 
 
 		 597 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  23.87 
 
 		 596 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  24.11 
 
 		 1141 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  23.03 
 
 		 600 aa  52.8  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3846  hypothetical protein  25.44 
 
 		 314 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.671238 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1672  glycoside hydrolase family 42 protein  27.12 
 
 		 640 aa  52  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.590042  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3266  hypothetical protein  26.64 
 
 		 307 aa  50.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.771752 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  21.49 
 
 		 489 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  22.44 
 
 		 554 aa  50.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  27.66 
 
 		 468 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.67 
 
 		 1086 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1195  hypothetical protein  20.6 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0627661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  26.32 
 
 		 1025 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  23.84 
 
 		 562 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0186  hypothetical protein  24.43 
 
 		 312 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.97275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  20.92 
 
 		 446 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0790  hypothetical protein  23.15 
 
 		 460 aa  47  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0442  hypothetical protein  24.77 
 
 		 311 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.131952  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0240  hypothetical protein  24.43 
 
 		 312 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2068  hypothetical protein  26.79 
 
 		 311 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.390518  normal  0.0103264 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  24.32 
 
 		 550 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3881  hypothetical protein  26.54 
 
 		 325 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4248  hypothetical protein  24.1 
 
 		 333 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0450926 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  21.79 
 
 		 326 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  23.83 
 
 		 457 aa  43.5  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>