40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3568 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  100 
 
 
457 aa  931    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  45.43 
 
 
489 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  38.39 
 
 
482 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  28.07 
 
 
448 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  23.68 
 
 
326 aa  111  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  23.9 
 
 
1276 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  26.44 
 
 
564 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  26.74 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  26.74 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  26.74 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  26.79 
 
 
554 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  24.38 
 
 
562 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  26.59 
 
 
1086 aa  63.5  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  25.32 
 
 
398 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  26.79 
 
 
873 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  22.07 
 
 
340 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  24.46 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  24.46 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  24.46 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  24.46 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  24.46 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  24.46 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  24.46 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  24.08 
 
 
450 aa  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  21.95 
 
 
444 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  23.43 
 
 
453 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  25.09 
 
 
444 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  27.4 
 
 
604 aa  47  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  21.88 
 
 
437 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  26.67 
 
 
372 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  22.57 
 
 
596 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  23.35 
 
 
891 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  25.4 
 
 
462 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.68 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  26.16 
 
 
602 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.24 
 
 
442 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  30.84 
 
 
417 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  27.64 
 
 
392 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  26.87 
 
 
1141 aa  43.5  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>