More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0542 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 439 aa  894    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  58.47 
 
 		 443 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  44.58 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  44.42 
 
 		 437 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  46 
 
 		 413 aa  336  5.999999999999999e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  41.65 
 
 		 419 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  44.28 
 
 		 447 aa  317  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  44.36 
 
 		 407 aa  312  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  40.49 
 
 		 401 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  38.31 
 
 		 388 aa  260  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  33.33 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 431 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 399 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  29.91 
 
 		 417 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 443 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  28.67 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  33.26 
 
 		 455 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  32.01 
 
 		 443 aa  169  9e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.12 
 
 		 427 aa  166  6.9999999999999995e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  24.77 
 
 		 442 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  31.58 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  32.35 
 
 		 440 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  31.36 
 
 		 440 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  29.21 
 
 		 478 aa  159  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  29.02 
 
 		 451 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  30.07 
 
 		 450 aa  158  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  27.08 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.28 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  30.75 
 
 		 482 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  29 
 
 		 452 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  28.88 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  29.35 
 
 		 439 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  25.42 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  28.7 
 
 		 448 aa  151  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  29.74 
 
 		 467 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  28.67 
 
 		 453 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  28.6 
 
 		 443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  28.45 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  27.84 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  28.11 
 
 		 470 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  29.26 
 
 		 457 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.29 
 
 		 459 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  28.17 
 
 		 454 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  26.91 
 
 		 462 aa  146  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  30.56 
 
 		 444 aa  146  9e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  28.67 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  27.17 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  26.36 
 
 		 446 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  29.46 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  28.6 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  26.74 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  30.45 
 
 		 433 aa  142  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  29.91 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  27.78 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  30.27 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  27.16 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  28.51 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  24.84 
 
 		 452 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3344  Beta-glucosidase  27.69 
 
 		 478 aa  140  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  26.55 
 
 		 451 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  28.82 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  28.85 
 
 		 486 aa  139  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  26.65 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  27.1 
 
 		 470 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  27.03 
 
 		 451 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  27.17 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  27.9 
 
 		 463 aa  137  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  26.9 
 
 		 465 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  29.76 
 
 		 458 aa  136  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  26.41 
 
 		 443 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  29.44 
 
 		 488 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  27.27 
 
 		 444 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  27.93 
 
 		 447 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  28.7 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  29.33 
 
 		 440 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  25.72 
 
 		 467 aa  130  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  28.54 
 
 		 436 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  26.09 
 
 		 453 aa  130  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  25.93 
 
 		 452 aa  130  6e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  30.45 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  28.89 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0657  beta-galactosidase  27.13 
 
 		 445 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.647462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  24.22 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  26.81 
 
 		 909 aa  127  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  27 
 
 		 450 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  27.44 
 
 		 458 aa  126  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  28.19 
 
 		 453 aa  126  7e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  24.84 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  26.39 
 
 		 479 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  25.64 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  25.16 
 
 		 486 aa  120  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  28.98 
 
 		 455 aa  121  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  27.65 
 
 		 450 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  41.36 
 
 		 457 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  28.72 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  29.04 
 
 		 463 aa  120  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  25.62 
 
 		 484 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  25.9 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>