More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0462 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  100 
 
 
418 aa  862    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  43.1 
 
 
431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  42.28 
 
 
431 aa  360  2e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 
442 aa  343  4e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  43.19 
 
 
417 aa  333  4e-90  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  39.3 
 
 
432 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  38.75 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  38.52 
 
 
443 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  36.97 
 
 
427 aa  306  4.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  37.2 
 
 
427 aa  286  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  36.79 
 
 
446 aa  283  6.000000000000001e-75  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  38.74 
 
 
399 aa  282  8.000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  36.34 
 
 
446 aa  278  9e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  37.14 
 
 
446 aa  271  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  36.22 
 
 
458 aa  268  1e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  36.06 
 
 
450 aa  265  2e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  34.81 
 
 
452 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  36.08 
 
 
439 aa  262  8e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  33.48 
 
 
472 aa  262  8.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  34.62 
 
 
413 aa  261  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  33.63 
 
 
453 aa  258  1e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 
447 aa  254  3e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  35.29 
 
 
407 aa  252  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  33.19 
 
 
471 aa  250  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  33.87 
 
 
443 aa  249  6e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  34.67 
 
 
451 aa  249  7e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  34.15 
 
 
452 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  32.16 
 
 
437 aa  248  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  32.96 
 
 
447 aa  247  3e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  34.51 
 
 
401 aa  247  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  35.81 
 
 
446 aa  245  9e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 
439 aa  245  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  32.18 
 
 
438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  32.47 
 
 
474 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  34.21 
 
 
388 aa  240  4e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  34.07 
 
 
456 aa  239  5e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  34.47 
 
 
465 aa  239  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  32.63 
 
 
411 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  32.63 
 
 
463 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  34.17 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  35.07 
 
 
439 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  31.7 
 
 
455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  33.72 
 
 
444 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  35.05 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  31.65 
 
 
454 aa  234  2.0000000000000002e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  32.74 
 
 
448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  35.37 
 
 
472 aa  233  6e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  31.57 
 
 
517 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  31.5 
 
 
494 aa  230  3e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  31.02 
 
 
478 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  34.86 
 
 
443 aa  229  7e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.76 
 
 
448 aa  229  7e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  31.7 
 
 
445 aa  229  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  29.07 
 
 
491 aa  229  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  30.82 
 
 
476 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  31.45 
 
 
478 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  35.8 
 
 
436 aa  228  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  34.11 
 
 
470 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  31.7 
 
 
479 aa  226  4e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  32.04 
 
 
449 aa  227  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  31.6 
 
 
489 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  34.52 
 
 
437 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  32.33 
 
 
484 aa  225  1e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  31.24 
 
 
456 aa  225  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.79 
 
 
458 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  32.81 
 
 
446 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  32.14 
 
 
475 aa  225  1e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  31.28 
 
 
465 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  30.92 
 
 
472 aa  225  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  32.64 
 
 
435 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  33.26 
 
 
450 aa  224  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  31.98 
 
 
467 aa  223  4e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  33.33 
 
 
466 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  32.95 
 
 
460 aa  223  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  33.57 
 
 
440 aa  222  9e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.72 
 
 
444 aa  222  9e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  33.26 
 
 
443 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 
478 aa  222  9.999999999999999e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  29.68 
 
 
500 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  31.11 
 
 
444 aa  220  3e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  31.78 
 
 
448 aa  220  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  30.51 
 
 
488 aa  220  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  30.13 
 
 
467 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  32.17 
 
 
482 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  28.94 
 
 
419 aa  218  1e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  30.51 
 
 
517 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  33.8 
 
 
453 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  29.03 
 
 
494 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  30.37 
 
 
474 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  30.41 
 
 
466 aa  217  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  33.73 
 
 
433 aa  216  7e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  32.24 
 
 
447 aa  216  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  32.39 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  32.59 
 
 
453 aa  214  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  32.32 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  31.48 
 
 
486 aa  213  2.9999999999999995e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  32.71 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  32.33 
 
 
451 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  30.26 
 
 
485 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  31.74 
 
 
457 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>