More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0789 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 443 aa  913    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  58.47 
 
 		 439 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 		 411 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  42.12 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  42.96 
 
 		 419 aa  328  9e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  41.99 
 
 		 413 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  42.01 
 
 		 447 aa  313  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  42.08 
 
 		 407 aa  301  2e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  39.8 
 
 		 401 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  37.8 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  33.87 
 
 		 418 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  34.11 
 
 		 431 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  31.54 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  33.86 
 
 		 436 aa  187  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  31.01 
 
 		 399 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 		 443 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  31.65 
 
 		 460 aa  173  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  30.59 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  29.03 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  31.53 
 
 		 449 aa  167  4e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  27.34 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  29.71 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  29.73 
 
 		 448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  29.25 
 
 		 457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  28.1 
 
 		 482 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  30.84 
 
 		 450 aa  163  6e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  30.13 
 
 		 474 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  30.11 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  28.09 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  28.76 
 
 		 456 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  30.32 
 
 		 443 aa  160  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  29.3 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  30.11 
 
 		 435 aa  158  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  29.61 
 
 		 470 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  28.67 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  29.98 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  26.73 
 
 		 427 aa  156  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  28.86 
 
 		 451 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  30 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  29.23 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  29.31 
 
 		 459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  29.34 
 
 		 472 aa  154  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  25.75 
 
 		 446 aa  153  5e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  25.75 
 
 		 446 aa  153  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  28.45 
 
 		 457 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  30 
 
 		 448 aa  152  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  28.45 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  27.44 
 
 		 438 aa  149  8e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  27.17 
 
 		 452 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  25.36 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  26.47 
 
 		 446 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  27.33 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  25.27 
 
 		 452 aa  146  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  29.06 
 
 		 472 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  26.77 
 
 		 439 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  28.1 
 
 		 468 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  26.98 
 
 		 465 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  30.33 
 
 		 472 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  30.59 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  28.66 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  29.61 
 
 		 478 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  26.06 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  30.41 
 
 		 437 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.33 
 
 		 452 aa  143  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  25.54 
 
 		 471 aa  143  5e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  26.16 
 
 		 452 aa  143  6e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  29.57 
 
 		 440 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  26.99 
 
 		 451 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  27.33 
 
 		 456 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  29.01 
 
 		 463 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  30.24 
 
 		 444 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  29.87 
 
 		 467 aa  141  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  26.67 
 
 		 451 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  26.67 
 
 		 451 aa  139  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  28.13 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  31.11 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  27.8 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  26.44 
 
 		 451 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  28.28 
 
 		 454 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  25.45 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  26.32 
 
 		 446 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  25.45 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  28.16 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  25.49 
 
 		 443 aa  133  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  27.62 
 
 		 488 aa  133  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  27.96 
 
 		 447 aa  132  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  26.42 
 
 		 475 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  26.62 
 
 		 444 aa  131  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  27.25 
 
 		 444 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  25.87 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  28.82 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  27.42 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  26.95 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  26.91 
 
 		 468 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  25.2 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  27.63 
 
 		 444 aa  124  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  27.31 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  28.93 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>