More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1937 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 427 aa  901    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  48.47 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  41.57 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  39.81 
 
 		 442 aa  335  1e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  37.2 
 
 		 418 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  33.02 
 
 		 417 aa  238  2e-61  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  31.86 
 
 		 436 aa  233  6e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  30.09 
 
 		 431 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  29.55 
 
 		 431 aa  209  8e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  30.93 
 
 		 446 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  31.94 
 
 		 399 aa  195  1e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  29.55 
 
 		 446 aa  189  7e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  29.32 
 
 		 446 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  29.49 
 
 		 457 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  31.34 
 
 		 443 aa  183  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  30.93 
 
 		 443 aa  182  9.000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  29.45 
 
 		 457 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  29.59 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  30.82 
 
 		 448 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  29.64 
 
 		 446 aa  181  2.9999999999999997e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  27.95 
 
 		 478 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  30.81 
 
 		 446 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  30.16 
 
 		 443 aa  177  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  29.07 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  28.95 
 
 		 407 aa  177  5e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  29.41 
 
 		 468 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 413 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 489 aa  176  9e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  29.02 
 
 		 470 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  27.86 
 
 		 478 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  30.14 
 
 		 447 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  29.67 
 
 		 444 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  31.16 
 
 		 451 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.07 
 
 		 449 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  28.08 
 
 		 452 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  29.02 
 
 		 419 aa  172  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  30.65 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  27.02 
 
 		 467 aa  172  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  27.91 
 
 		 491 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  24.85 
 
 		 517 aa  170  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  28.86 
 
 		 453 aa  170  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  29.2 
 
 		 458 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  29.26 
 
 		 451 aa  169  7e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  28.67 
 
 		 456 aa  169  7e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  28.25 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  30.18 
 
 		 451 aa  168  1e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  29.34 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  28.57 
 
 		 465 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  27.9 
 
 		 457 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  28.76 
 
 		 450 aa  167  5e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  28.38 
 
 		 438 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  29.72 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  27.47 
 
 		 513 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  28.48 
 
 		 452 aa  166  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  27.65 
 
 		 482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  27.44 
 
 		 470 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  26.74 
 
 		 463 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  27.83 
 
 		 471 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  28.7 
 
 		 444 aa  164  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 443 aa  162  8.000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  29.09 
 
 		 450 aa  162  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  28.69 
 
 		 411 aa  162  9e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  26.43 
 
 		 472 aa  162  9e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  28.26 
 
 		 456 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  28.25 
 
 		 467 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  27.57 
 
 		 463 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  25.75 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  28 
 
 		 472 aa  161  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  27.96 
 
 		 453 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  28.09 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  27.25 
 
 		 484 aa  159  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  29.4 
 
 		 478 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  24.13 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  26.8 
 
 		 487 aa  158  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  26.18 
 
 		 479 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  29.19 
 
 		 450 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  28.63 
 
 		 479 aa  156  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  29.17 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  27.8 
 
 		 499 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  28.28 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  27.94 
 
 		 909 aa  155  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  26.68 
 
 		 476 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  27.59 
 
 		 466 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  27.15 
 
 		 460 aa  155  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  25.59 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  26.8 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  28.12 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  26.85 
 
 		 440 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  28.88 
 
 		 485 aa  153  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  28.96 
 
 		 444 aa  153  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  27.79 
 
 		 447 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  26.34 
 
 		 440 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  27.45 
 
 		 482 aa  151  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  27.61 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 473 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  25.74 
 
 		 458 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  27.08 
 
 		 467 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  28.35 
 
 		 458 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>