More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1932 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 431 aa  887    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  93.5 
 
 		 431 aa  842    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  43.1 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  43.74 
 
 		 443 aa  336  5e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  43.66 
 
 		 436 aa  317  3e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 442 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  35.13 
 
 		 432 aa  289  6e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  35.78 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  31.79 
 
 		 439 aa  242  1e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  34.76 
 
 		 399 aa  233  7.000000000000001e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  31.7 
 
 		 446 aa  229  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  32 
 
 		 446 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  32 
 
 		 446 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  33.88 
 
 		 443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  33.57 
 
 		 447 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  34.3 
 
 		 450 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  34.01 
 
 		 439 aa  215  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  34.26 
 
 		 455 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  34.31 
 
 		 407 aa  214  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  32.76 
 
 		 472 aa  213  4.9999999999999996e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  28.81 
 
 		 427 aa  212  1e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  32.81 
 
 		 458 aa  210  4e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 437 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  29 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  31.57 
 
 		 478 aa  205  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  31.76 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  34.06 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  34.56 
 
 		 388 aa  201  3e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  32.54 
 
 		 463 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.79 
 
 		 444 aa  200  5e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  32.12 
 
 		 439 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 		 467 aa  199  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  31.67 
 
 		 478 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  30.32 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  32.56 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  30 
 
 		 447 aa  197  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  28.57 
 
 		 465 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  28.41 
 
 		 446 aa  196  9e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  32.24 
 
 		 456 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  29.04 
 
 		 427 aa  194  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  31.59 
 
 		 463 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  30.31 
 
 		 452 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  29.35 
 
 		 489 aa  192  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  30.4 
 
 		 474 aa  192  9e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  28.39 
 
 		 452 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  33.26 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  31.34 
 
 		 470 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 517 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  30.18 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  32.54 
 
 		 478 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.22 
 
 		 471 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  30.5 
 
 		 447 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  31.72 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  33.49 
 
 		 447 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  32.06 
 
 		 465 aa  187  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  30.97 
 
 		 472 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  31.11 
 
 		 440 aa  186  7e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  34.77 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  30.6 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  31.79 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  30.59 
 
 		 457 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  33.11 
 
 		 437 aa  184  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  30.19 
 
 		 484 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  31 
 
 		 474 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  28.85 
 
 		 450 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  30.14 
 
 		 457 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  29.72 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  30.49 
 
 		 456 aa  182  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  27.79 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.96 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  28.81 
 
 		 494 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.72 
 
 		 449 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  30.02 
 
 		 486 aa  180  4.999999999999999e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  29.82 
 
 		 444 aa  180  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  31.89 
 
 		 460 aa  179  5.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  31.99 
 
 		 494 aa  179  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  29.49 
 
 		 482 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  32.53 
 
 		 457 aa  179  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  30.07 
 
 		 454 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  32.2 
 
 		 445 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  28.57 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  29.17 
 
 		 452 aa  177  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  31.39 
 
 		 488 aa  177  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  34.07 
 
 		 443 aa  177  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  28.54 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  30.64 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  30.31 
 
 		 487 aa  172  6.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  29.65 
 
 		 470 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  30.96 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  29.79 
 
 		 467 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  26.72 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  29.5 
 
 		 473 aa  171  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  30.73 
 
 		 453 aa  170  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  30.43 
 
 		 479 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  29.39 
 
 		 467 aa  169  8e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  28.49 
 
 		 513 aa  169  8e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  27.81 
 
 		 451 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  28.86 
 
 		 462 aa  169  9e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>