More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5280 on replicon NC_010335
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 411 aa  848    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  61.1 
 
 		 437 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  48.91 
 
 		 413 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  45.73 
 
 		 447 aa  358  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  44.58 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  47.03 
 
 		 419 aa  344  2e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  43.24 
 
 		 443 aa  334  2e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  44.09 
 
 		 407 aa  308  8e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  41.67 
 
 		 401 aa  300  4e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  40.35 
 
 		 388 aa  260  3e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  32.63 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  34.75 
 
 		 431 aa  207  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  34.68 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  30.94 
 
 		 417 aa  202  6e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  31.9 
 
 		 399 aa  192  7e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  31.36 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  29.29 
 
 		 442 aa  186  5e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  28.54 
 
 		 432 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.64 
 
 		 448 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  32.8 
 
 		 444 aa  177  4e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  32.59 
 
 		 458 aa  176  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  30.74 
 
 		 450 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  29.46 
 
 		 452 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  31.47 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  32.65 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.37 
 
 		 449 aa  170  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 		 443 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  29.05 
 
 		 450 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.67 
 
 		 471 aa  168  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  28.07 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  26.81 
 
 		 438 aa  166  5e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  29.35 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  29.23 
 
 		 446 aa  166  8e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  31.76 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  29.49 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  27.41 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 427 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  27.74 
 
 		 439 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  30.09 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  29.62 
 
 		 459 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  29.81 
 
 		 444 aa  160  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  30.37 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  27.33 
 
 		 474 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  30.52 
 
 		 440 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  28.38 
 
 		 448 aa  159  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  30.13 
 
 		 465 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  30.49 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  30.43 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  27.17 
 
 		 451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  27.99 
 
 		 478 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  27.98 
 
 		 482 aa  155  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  30.37 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  28.26 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  28.89 
 
 		 458 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  27.48 
 
 		 488 aa  152  8e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  31.44 
 
 		 453 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  29.93 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  29.59 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  28.2 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  30.87 
 
 		 440 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  27.65 
 
 		 494 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  30.73 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  28.89 
 
 		 488 aa  150  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  28.51 
 
 		 489 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  30.73 
 
 		 444 aa  149  9e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  31.21 
 
 		 471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  26.57 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  27.6 
 
 		 458 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  28.8 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  30.62 
 
 		 443 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  28.99 
 
 		 473 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  27.09 
 
 		 462 aa  145  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  28.76 
 
 		 468 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.4 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  28.18 
 
 		 458 aa  144  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  26.54 
 
 		 470 aa  144  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  28.86 
 
 		 451 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  28.05 
 
 		 456 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  27.56 
 
 		 451 aa  142  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  26.76 
 
 		 447 aa  142  9.999999999999999e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  28.14 
 
 		 478 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  30.32 
 
 		 447 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  26.36 
 
 		 446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  28.66 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  27.04 
 
 		 476 aa  140  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  26.73 
 
 		 443 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  29.3 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D39  6-phospho-beta-galactosidase  28.1 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4086  beta-galactosidase  28.51 
 
 		 486 aa  138  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  28.92 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  28.26 
 
 		 474 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  28.44 
 
 		 456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  28.51 
 
 		 467 aa  136  8e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  26.94 
 
 		 484 aa  135  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  24.84 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  28.25 
 
 		 457 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  27.68 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  28.04 
 
 		 452 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  25.43 
 
 		 465 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  26.89 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>