More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  100 
 
 		 407 aa  825    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  54.76 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  53.83 
 
 		 388 aa  403  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  48.43 
 
 		 413 aa  344  1e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  44.8 
 
 		 419 aa  338  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  47.04 
 
 		 447 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  43.07 
 
 		 437 aa  312  6.999999999999999e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  44.36 
 
 		 439 aa  312  9e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  44.09 
 
 		 411 aa  308  8e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  42.08 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  35.29 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  34.31 
 
 		 431 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 431 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  30.75 
 
 		 417 aa  204  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  34.17 
 
 		 450 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  31.89 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  32.14 
 
 		 482 aa  186  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  32.97 
 
 		 472 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  31.34 
 
 		 472 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  32.84 
 
 		 479 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  31.85 
 
 		 448 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  32.53 
 
 		 458 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  29.27 
 
 		 442 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  32.27 
 
 		 443 aa  180  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  33.26 
 
 		 444 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  32.89 
 
 		 455 aa  179  4.999999999999999e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  34.74 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  30.65 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  28.47 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  34.25 
 
 		 440 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  32.41 
 
 		 440 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  28.71 
 
 		 427 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  34.25 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  28.7 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  26.93 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  31.16 
 
 		 447 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  30.84 
 
 		 436 aa  171  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  30.46 
 
 		 453 aa  171  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  33.18 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  28.67 
 
 		 439 aa  169  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  31.47 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  32.41 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  28.29 
 
 		 474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  32.52 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  31.5 
 
 		 500 aa  166  6.9999999999999995e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  33.72 
 
 		 459 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  30.56 
 
 		 478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  29.77 
 
 		 446 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  32.18 
 
 		 460 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  33.18 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  31.86 
 
 		 488 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  31.63 
 
 		 471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  30.43 
 
 		 452 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.56 
 
 		 427 aa  162  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  28.6 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  31.97 
 
 		 472 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  32.92 
 
 		 482 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  32.46 
 
 		 489 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  28.6 
 
 		 446 aa  162  1e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  33.33 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  31.66 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  34.19 
 
 		 436 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  32.52 
 
 		 463 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  31.89 
 
 		 435 aa  160  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.54 
 
 		 449 aa  159  6e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  29.81 
 
 		 470 aa  159  8e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  30.43 
 
 		 456 aa  159  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  29.17 
 
 		 451 aa  158  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  32.06 
 
 		 448 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  30.25 
 
 		 463 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  30.31 
 
 		 443 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  29.02 
 
 		 438 aa  157  3e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  31.83 
 
 		 458 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  29.93 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  30 
 
 		 440 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  28.41 
 
 		 450 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  30.67 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  31.41 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  29.87 
 
 		 457 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  30.54 
 
 		 467 aa  154  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  32.1 
 
 		 448 aa  153  5e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  28.9 
 
 		 450 aa  152  7e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  33.18 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  27.79 
 
 		 444 aa  151  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  29.55 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  30.22 
 
 		 456 aa  150  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  30.9 
 
 		 458 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  30.09 
 
 		 453 aa  150  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  29.02 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  28.21 
 
 		 462 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  29.98 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  27.79 
 
 		 465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  26.99 
 
 		 484 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  28.82 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  28.41 
 
 		 452 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  29.6 
 
 		 465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  31.54 
 
 		 458 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  28.54 
 
 		 475 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  28.14 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  27.79 
 
 		 451 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>