More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0511 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 401 aa  820    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  54.76 
 
 		 407 aa  430  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  56.7 
 
 		 388 aa  419  1e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  51.93 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  51.09 
 
 		 447 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  44.28 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 		 411 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  40.24 
 
 		 437 aa  279  6e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  40.49 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  39.8 
 
 		 443 aa  268  2e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  34.51 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  34.06 
 
 		 431 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  33.82 
 
 		 431 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  30.17 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  33.17 
 
 		 399 aa  189  8e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  33.11 
 
 		 450 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  30.3 
 
 		 432 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  34.25 
 
 		 436 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  31.64 
 
 		 453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  29.49 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  28.95 
 
 		 471 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  33.64 
 
 		 444 aa  179  5.999999999999999e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  34.16 
 
 		 458 aa  176  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  31.44 
 
 		 455 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  30.5 
 
 		 474 aa  175  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  33.26 
 
 		 439 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  31.1 
 
 		 447 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  29.1 
 
 		 478 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  33.84 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  29.31 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  29.31 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  31.6 
 
 		 447 aa  170  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  32.29 
 
 		 448 aa  169  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  28.15 
 
 		 446 aa  169  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1944  Beta-glucosidase  33.73 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.781532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 478 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  31.19 
 
 		 453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  32.49 
 
 		 437 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  32.22 
 
 		 452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  32.88 
 
 		 436 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  31.5 
 
 		 488 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  32.44 
 
 		 489 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  28.8 
 
 		 438 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  30.25 
 
 		 470 aa  164  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  31.32 
 
 		 482 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  27.9 
 
 		 452 aa  163  6e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  28.11 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  31.66 
 
 		 459 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  30.65 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  31.49 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  29.05 
 
 		 450 aa  161  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  30.41 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1654  beta-glucosidase A  33.17 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.484784  hitchhiker  0.0000345699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  28.81 
 
 		 472 aa  160  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  31.26 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  30.54 
 
 		 440 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  30.91 
 
 		 458 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  30.99 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  30.08 
 
 		 474 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  30.73 
 
 		 467 aa  155  9e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  30.73 
 
 		 448 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  28.88 
 
 		 451 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  31.54 
 
 		 453 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  29.3 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  30.75 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  28.18 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  32.18 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  28.6 
 
 		 449 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  31.32 
 
 		 458 aa  149  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  29.8 
 
 		 465 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  29.86 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  29.33 
 
 		 457 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  28.17 
 
 		 447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  29.17 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  27.12 
 
 		 475 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  30.13 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  28.9 
 
 		 474 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  28.54 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  29.02 
 
 		 454 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1838  beta-galactosidase  28.7 
 
 		 451 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  29.23 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  27.62 
 
 		 475 aa  144  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  27.9 
 
 		 467 aa  143  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  31.36 
 
 		 462 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  28.96 
 
 		 470 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  28.09 
 
 		 457 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3459  6-phospho-beta-galactosidase  28.39 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000864556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  30.91 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  29.75 
 
 		 458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  27.62 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  31.58 
 
 		 444 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  27.48 
 
 		 462 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  27.59 
 
 		 467 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  25 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  28.44 
 
 		 452 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  27.23 
 
 		 485 aa  138  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  27.27 
 
 		 478 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  30.02 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  27.64 
 
 		 468 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>