More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1461 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1544  beta-glucosidase  61.97 
 
 		 478 aa  635    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.194171  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0968  glycoside hydrolase family 1  61.51 
 
 		 480 aa  639    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 478 aa  1003    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1103  6-phospho-beta-glucosidase  53.01 
 
 		 478 aa  539  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0860  beta-glucosidase  53.68 
 
 		 479 aa  538  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0878  glycoside hydrolase family 6-phospho-beta-glucosidase  53.26 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0383438  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0785  glycoside hydrolase family protein  53.57 
 
 		 479 aa  528  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2481  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  52.11 
 
 		 476 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3001  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  52.01 
 
 		 474 aa  521  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3160  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  52.01 
 
 		 474 aa  518  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2840  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  52.01 
 
 		 474 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.106134 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0973  glycoside hydrolase family 1  51.37 
 
 		 474 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0764  glycoside hydrolase family 1  52.46 
 
 		 489 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0996  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.37 
 
 		 474 aa  515  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0301517 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3967  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.59 
 
 		 474 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0748  glycoside hydrolase family 1  52.38 
 
 		 496 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2140  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.9 
 
 		 476 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.854328  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2852  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.37 
 
 		 474 aa  514  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3189  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  52.22 
 
 		 474 aa  517  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1821  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  51.59 
 
 		 476 aa  509  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230632  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02566  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.53 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0889  glycoside hydrolase family 1  53.12 
 
 		 480 aa  508  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2547  glycoside hydrolase family 1  50 
 
 		 479 aa  505  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0806308  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02531  hypothetical protein  50.53 
 
 		 474 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0575  cryptic 6-phospho-beta-glucosidase  50.11 
 
 		 476 aa  499  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.603105  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0791  6-phospho-beta-glucosidase  50.52 
 
 		 475 aa  493  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.240964  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3733  glycoside hydrolase family 1  51.35 
 
 		 478 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3567  glycoside hydrolase family 1  51.67 
 
 		 478 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0765  6-phospho-beta-glucosidase  52.71 
 
 		 465 aa  492  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3208  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.48 
 
 		 477 aa  485  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.962709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3283  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.48 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2793  glycoside hydrolase family 1  50.21 
 
 		 473 aa  486  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0271062  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3286  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.48 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2841  glycoside hydrolase family protein  51.05 
 
 		 467 aa  485  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1352  glycoside hydrolase family 1  49.37 
 
 		 471 aa  486  1e-136  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3388  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.48 
 
 		 477 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0767  glycoside hydrolase family 1  47.79 
 
 		 475 aa  482  1e-135  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3220  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.9 
 
 		 477 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.276018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2805  glycoside hydrolase family protein  48.12 
 
 		 478 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1478  6-phospho-beta-glucosidase  48.12 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.45642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3034  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.27 
 
 		 479 aa  479  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1165  6-phospho-beta-glucosidase  49.58 
 
 		 478 aa  479  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2729  6-phospho-beta-glucosidase BglA  48.33 
 
 		 478 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.36988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2438  glycoside hydrolase family 1  51.05 
 
 		 468 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0255622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02733  6-phospho-beta-glucosidase A  48.85 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0791  glycoside hydrolase family 1  49.06 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2500  glycoside hydrolase family protein  48.34 
 
 		 478 aa  477  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2741  glycoside hydrolase family 1  51.05 
 
 		 466 aa  477  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0749  glycoside hydrolase family 1  50.21 
 
 		 465 aa  478  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0808  glycoside hydrolase family protein  49.06 
 
 		 477 aa  478  1e-133  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.785665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3228  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.06 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0011  glycoside hydrolase family 1  48.26 
 
 		 480 aa  476  1e-133  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3060  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.06 
 
 		 479 aa  477  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02696  hypothetical protein  48.85 
 
 		 479 aa  476  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0902  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.45 
 
 		 486 aa  472  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.682086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0012  glycoside hydrolase family 1  47.76 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2739  glycoside hydrolase family protein  51.27 
 
 		 465 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4193  6-phospho-beta-glucosidase BglA  49.06 
 
 		 479 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1348  glycoside hydrolase family 1  48.66 
 
 		 487 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.843045  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3322  6-phospho-beta-glucosidase BglA  48.85 
 
 		 479 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0224  6-phospho-beta-glucosidase  50 
 
 		 480 aa  468  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3320  glycoside hydrolase family protein  48.43 
 
 		 477 aa  468  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.974893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3965  glycoside hydrolase family protein  49.07 
 
 		 487 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.300617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4246  glycoside hydrolase family 1  50.11 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4273  glycoside hydrolase family protein  50.11 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0469  6-phospho-beta-glucosidase  48.54 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0340  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.56 
 
 		 481 aa  464  1e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1668  glycoside hydrolase family 1  51.48 
 
 		 465 aa  464  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.373408  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0927  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.66 
 
 		 478 aa  462  1e-129  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2987  6-phospho-beta-glucosidase  49.48 
 
 		 476 aa  464  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0783146 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03605  cryptic phospho-beta-glucosidase B  49.89 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3935  6-phospho-beta-glucosidase  50.11 
 
 		 470 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0341  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.02 
 
 		 485 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000818  6-phospho-beta-glucosidase  50.53 
 
 		 463 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4230  6-phospho-beta-glucosidase  49.89 
 
 		 464 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1048  glycoside hydrolase family 1  48.76 
 
 		 483 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl012  beta-glucosidase  45.72 
 
 		 484 aa  455  1e-127  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0190  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  46.87 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.136833 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1705  glycoside hydrolase family 1  50.21 
 
 		 465 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.864133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1668  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.3 
 
 		 491 aa  456  1e-127  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.396346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06724  phospho-beta-glucosidase B  50 
 
 		 463 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0185  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  48.87 
 
 		 496 aa  454  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000347604  hitchhiker  0.00387129 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0257  glycoside hydrolase family protein  49.38 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3901  glycoside hydrolase family 1  48.23 
 
 		 479 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00796853  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0251  glycoside hydrolase family protein  49.38 
 
 		 478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1735  6-phospho-beta-glucosidase  46.68 
 
 		 479 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1407  glycoside hydrolase family 1  49.16 
 
 		 464 aa  451  1e-125  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl034  6-phospho-beta-glucosidase  45.05 
 
 		 483 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1637  6-phospho-beta-glucosidase  46.68 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1615  6-phospho-beta-glucosidase  47.1 
 
 		 479 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0543  glycoside hydrolase family 1  49.68 
 
 		 462 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0771  glycoside hydrolase family 1  49.05 
 
 		 462 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.935854  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl615  beta-glucosidase  44.21 
 
 		 483 aa  437  1e-121  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1891  glycoside hydrolase family protein  47.62 
 
 		 483 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.001415  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl009  beta-glucosidase  44.24 
 
 		 487 aa  421  1e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl430  6-phospho-beta-glucosidase  44.56 
 
 		 480 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3467  glycoside hydrolase family 1  43.61 
 
 		 475 aa  405  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0716612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0345  6-phospho-beta-glucosidase  44 
 
 		 455 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0942  Beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  42.68 
 
 		 474 aa  390  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.933475  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1754  6-phospho-beta-glucosidase  43.72 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000312177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>