More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2526 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  100 
 
 		 388 aa  796    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0511  glycoside hydrolase family 1  56.7 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  53.83 
 
 		 407 aa  403  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  47.82 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  46.7 
 
 		 447 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  42.96 
 
 		 419 aa  305  9.000000000000001e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 437 aa  271  2e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  40.35 
 
 		 411 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  38.31 
 
 		 439 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  37.8 
 
 		 443 aa  250  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  34.21 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  32.28 
 
 		 417 aa  210  3e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  34.96 
 
 		 431 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  34.56 
 
 		 431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  34.55 
 
 		 399 aa  189  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  32.89 
 
 		 448 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  31.48 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  32.73 
 
 		 450 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  29.93 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  30.04 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  32.29 
 
 		 446 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  33.8 
 
 		 436 aa  172  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0374  beta-galactosidase  29.05 
 
 		 450 aa  169  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  34.3 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  33.04 
 
 		 488 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  31.95 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  30.36 
 
 		 453 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  29.57 
 
 		 446 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  27.93 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  32.88 
 
 		 439 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  29.45 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  32.07 
 
 		 455 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  28.44 
 
 		 446 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  30.44 
 
 		 451 aa  159  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  32.71 
 
 		 436 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  28.44 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  32.27 
 
 		 453 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  31.32 
 
 		 500 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  31.83 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  31.91 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  32.2 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  32.2 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  32.81 
 
 		 447 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  30.82 
 
 		 467 aa  155  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  30.41 
 
 		 472 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0743  Beta-glucosidase  30.28 
 
 		 475 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  30.67 
 
 		 453 aa  154  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  31.46 
 
 		 467 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3811  b-glucosidase  28.51 
 
 		 462 aa  152  7e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  31.84 
 
 		 468 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  30.84 
 
 		 487 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  29.74 
 
 		 479 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0979  Beta-glucosidase  29.64 
 
 		 475 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  31.18 
 
 		 450 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  29.65 
 
 		 474 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  29.12 
 
 		 485 aa  149  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  30.23 
 
 		 448 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1146  Beta-glucosidase  30.66 
 
 		 440 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  31.52 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  31.14 
 
 		 478 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  28.09 
 
 		 427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  30.3 
 
 		 478 aa  147  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3309  Beta-glucosidase  32.47 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.581632  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50351  beta-glucosidase  29.26 
 
 		 909 aa  147  4.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00482034  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  29.53 
 
 		 470 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  29.86 
 
 		 482 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  31.84 
 
 		 463 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1936  beta-galactosidase  30.02 
 
 		 458 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  31.13 
 
 		 458 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  32.64 
 
 		 437 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  31.08 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  26.14 
 
 		 452 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1327  glycoside hydrolase family 1  29.06 
 
 		 474 aa  144  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.294079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  30.26 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  32.26 
 
 		 444 aa  143  4e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  29.95 
 
 		 440 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  28.77 
 
 		 438 aa  142  7e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111423  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1456  glycoside hydrolase family 1  29.72 
 
 		 430 aa  142  8e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  29.66 
 
 		 450 aa  142  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  30.45 
 
 		 456 aa  140  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  29.89 
 
 		 489 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  29.14 
 
 		 447 aa  139  7.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  30.68 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  29.49 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  33.02 
 
 		 444 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  30.46 
 
 		 458 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2324  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 470 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  27.02 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1895  beta-galactosidase  29.67 
 
 		 454 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  28.34 
 
 		 467 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1461  glycoside hydrolase family 1  28.81 
 
 		 478 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.329338  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0344  6-phospho-beta-galactosidase  25.8 
 
 		 484 aa  137  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000215907  hitchhiker  0.000984044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  26.94 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  30.14 
 
 		 463 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2603  6-phospho-beta-glucosidase bgla  26.56 
 
 		 478 aa  135  9e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  27.96 
 
 		 479 aa  135  9e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  29.91 
 
 		 440 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3044  beta-glucosidase  28.04 
 
 		 461 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  29.91 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  29 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>