More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4014 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4014  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 
443 aa  918    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.92245  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2967  glycoside hydrolase family protein  44.68 
 
 
431 aa  341  1e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1932  glycoside hydrolase family protein  43.74 
 
 
431 aa  336  5e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.536159  hitchhiker  0.00000905056 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0462  Beta-glucosidase  38.52 
 
 
418 aa  317  3e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.626526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6082  glycoside hydrolase family 1  38.98 
 
 
436 aa  288  2e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1428  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 
442 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.574986  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0529  glycoside hydrolase family 1  36.09 
 
 
417 aa  264  3e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04820  Beta-glucosidase  33.8 
 
 
432 aa  250  3e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0266886  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1937  glycoside hydrolase family protein  33.72 
 
 
427 aa  224  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.607025  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1882  glycosy hydrolase family protein  31.05 
 
 
427 aa  223  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.31737  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1537  glycoside hydrolase family protein  31.68 
 
 
399 aa  207  2e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37521  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1675  glycoside hydrolase family protein  30.99 
 
 
513 aa  202  9e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.256832  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1110  glycoside hydrolase family protein  29.81 
 
 
517 aa  190  4e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  32.81 
 
 
450 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  30.02 
 
 
447 aa  185  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  30.16 
 
 
446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000326763  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  30.16 
 
 
446 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  30.48 
 
 
446 aa  184  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  30.92 
 
 
447 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0542  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 
439 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.294362  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  29.11 
 
 
446 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000188458  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  31.49 
 
 
455 aa  182  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0408  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 
489 aa  178  2e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0125143  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  32.39 
 
 
457 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4005  glycoside hydrolase family protein  30.5 
 
 
437 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0789  glycoside hydrolase family protein  29.89 
 
 
443 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0245888  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  30.43 
 
 
449 aa  176  7e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1558  glycoside hydrolase family protein  28.9 
 
 
467 aa  176  8e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000340299  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0652  glycoside hydrolase family protein  29.98 
 
 
486 aa  175  9.999999999999999e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.000000000739457  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  29.98 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  30.84 
 
 
453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  29.82 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  30.24 
 
 
452 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  31.19 
 
 
448 aa  172  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  32.05 
 
 
472 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  29.25 
 
 
457 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  28.57 
 
 
451 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  30.56 
 
 
444 aa  171  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000531793  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  29.24 
 
 
478 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  29.54 
 
 
453 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  28.57 
 
 
451 aa  171  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  29.61 
 
 
470 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5280  glycoside hydrolase family protein  28.29 
 
 
411 aa  169  6e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0160415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  28.34 
 
 
443 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1216  beta-glucosidase  28.67 
 
 
451 aa  169  1e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.282879  normal  0.209165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 
478 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2526  glycoside hydrolase family 1  31.95 
 
 
388 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  29.33 
 
 
474 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000277167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  28.41 
 
 
439 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  30.02 
 
 
468 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  28.47 
 
 
451 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  28.7 
 
 
463 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4660  glycoside hydrolase family protein  30.37 
 
 
413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.503774  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  28.8 
 
 
457 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  29.22 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  30.68 
 
 
460 aa  163  5.0000000000000005e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  31.17 
 
 
471 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  28.35 
 
 
453 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  28 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000225524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3627  Beta-glucosidase  29.59 
 
 
458 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.904469  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  31.74 
 
 
443 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  28.31 
 
 
463 aa  161  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5207  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
471 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226411  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5652  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 
471 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03797  beta-glucosidase  29.7 
 
 
452 aa  160  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  28.73 
 
 
458 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  28.7 
 
 
482 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  29.71 
 
 
439 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  27.52 
 
 
446 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0421  glycoside hydrolase family 1  28.64 
 
 
419 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  28.25 
 
 
448 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  28.96 
 
 
467 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  28.35 
 
 
448 aa  158  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  29.66 
 
 
453 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  29.27 
 
 
447 aa  158  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3061  beta-galactosidase  29.63 
 
 
456 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3523  Beta-glucosidase  26.34 
 
 
465 aa  158  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.233162  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6477  putative beta-glucosidase  29.59 
 
 
450 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.87446  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  29.26 
 
 
444 aa  157  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  28.73 
 
 
465 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  29.48 
 
 
452 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  28.67 
 
 
456 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02700  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  30.31 
 
 
407 aa  157  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  28.66 
 
 
491 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  29.12 
 
 
474 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  30.82 
 
 
482 aa  156  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3254  glycoside hydrolase family protein  26.42 
 
 
447 aa  156  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  30.11 
 
 
436 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  29.8 
 
 
458 aa  155  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000180548  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  28.01 
 
 
470 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  28.57 
 
 
456 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  28.22 
 
 
517 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  27.16 
 
 
452 aa  154  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000753308  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2629  beta-glucosidase  29.15 
 
 
443 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180075  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  29.67 
 
 
459 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1840  Beta-glucosidase  27.54 
 
 
458 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185877  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0502  6-phospho-beta-galactosidase  26.01 
 
 
475 aa  153  5e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  30.57 
 
 
500 aa  152  8.999999999999999e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4857  Beta-glucosidase  27.5 
 
 
450 aa  152  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.368438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2997  Beta-glucosidase  26.14 
 
 
461 aa  151  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000585051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>