41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4673 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_4673  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  987    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3568  hypothetical protein  45.15 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228234  normal  0.711115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3558  hypothetical protein  36.38 
 
 		 482 aa  270  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal  0.497656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5546  hypothetical protein  27.88 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  26.17 
 
 		 1276 aa  107  6e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  23.69 
 
 		 326 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  26.07 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  26.07 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  26.07 
 
 		 450 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  25.64 
 
 		 564 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.37 
 
 		 554 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  23.92 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  27.24 
 
 		 873 aa  60.1  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  25.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  22.81 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  25.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  25.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  25.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  25.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  25.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  25.16 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  21.61 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  23.54 
 
 		 450 aa  56.2  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1086 aa  55.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  23.36 
 
 		 408 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  21.88 
 
 		 340 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  23.46 
 
 		 447 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  22.84 
 
 		 600 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  26.38 
 
 		 398 aa  53.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  24.01 
 
 		 597 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  20.72 
 
 		 434 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  25.34 
 
 		 604 aa  50.8  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  21.49 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  23.45 
 
 		 596 aa  50.4  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  25.67 
 
 		 602 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  21.73 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  24.61 
 
 		 437 aa  47.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  23.58 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0190  hypothetical protein  25.81 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  32.35 
 
 		 417 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  25.93 
 
 		 586 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>