74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2654 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  84 
 
 		 550 aa  924    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  100 
 
 		 550 aa  1107    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  54.34 
 
 		 1025 aa  552  1e-156  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  43.68 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  30.97 
 
 		 392 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  27.99 
 
 		 408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  31.09 
 
 		 380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  29.19 
 
 		 447 aa  130  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  28.11 
 
 		 453 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  27.13 
 
 		 369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  27.89 
 
 		 601 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  26.03 
 
 		 586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  26.7 
 
 		 446 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  27.89 
 
 		 601 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  26.96 
 
 		 600 aa  114  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  27.25 
 
 		 596 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  27.59 
 
 		 436 aa  109  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  26.5 
 
 		 597 aa  107  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  26.39 
 
 		 461 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  27.54 
 
 		 425 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  27.1 
 
 		 434 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  27.35 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  25.86 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.96 
 
 		 340 aa  95.5  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  25.19 
 
 		 1276 aa  91.3  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  25 
 
 		 662 aa  76.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  24.52 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  25.94 
 
 		 803 aa  73.9  0.000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  25.98 
 
 		 801 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  26.52 
 
 		 596 aa  69.3  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  22.69 
 
 		 534 aa  67  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0533  hypothetical protein  26 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0333949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  23.2 
 
 		 558 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  21.83 
 
 		 1141 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  21.24 
 
 		 891 aa  62  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  23.76 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2537  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.73 
 
 		 685 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3419  hypothetical protein  24.85 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  23.76 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  23.76 
 
 		 510 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  23.1 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  23.43 
 
 		 510 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1684  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.18 
 
 		 684 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.155843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  23.43 
 
 		 510 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  23.39 
 
 		 398 aa  57.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  23.36 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  27.63 
 
 		 602 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1593  hypothetical protein  22.65 
 
 		 326 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559192  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  24.26 
 
 		 605 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0519  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 672 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.812808  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.97 
 
 		 672 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  25.79 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  25.79 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  25.79 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  25.79 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  25.79 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  25.79 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  25.79 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2430  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.9 
 
 		 669 aa  50.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0960663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  26.32 
 
 		 604 aa  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4164  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3314  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5580  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.76 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.147717  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4202  hypothetical protein  26.2 
 
 		 450 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.603749 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  23.57 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  26.98 
 
 		 614 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3420  hypothetical protein  28.44 
 
 		 468 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  24.32 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  27.94 
 
 		 564 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  24.32 
 
 		 442 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  26.55 
 
 		 873 aa  43.9  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  26.16 
 
 		 450 aa  43.9  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0399  hypothetical protein  34.53 
 
 		 432 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>